Difference between revisions of "Team:Fudan/Software"

Line 1: Line 1:
 
{{Fudan}}
 
{{Fudan}}
−
<html>
+
<html lang="en">
 +
<!--
 +
This html document is created by Tian Huang for Team Fudan iGEM 2018.
 +
We make it compatible on laptop and mobile devices by using Materialize 1.0.0-rc.2.
 +
-->
 +
<head>
 +
    <meta charset="UTF-8">
  
 +
    <!-- CSS -->
 +
    <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2018.igem.org/wiki/index.php?title=Template:Fudan/css.css&action=raw&ctype=text/css" />
  
 +
    <!-- Font-awesome icons 4.7.0 -->
 +
    <link href="https://2018.igem.org/wiki/index.php?title=Template:Fudan/font-awesome.css&action=raw&ctype=text/css" rel="stylesheet">
  
−
<div class="clear"></div>
+
    <!-- Materialize 1.0.0-rc.2 (Material Design like) -->
 +
    <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/wiki/index.php?title=Template:Fudan/materialize.css&action=raw&ctype=text/css">
  
 +
    <!-- Clear default CSS settings; CSS reset -->
 +
    <style type="text/css">
 +
        *{margin: 0;padding: 0;list-style: none;}
 +
        /* via: https://blog.csdn.net/weixin_41014370/article/details/79523637 */
  
−
<div class="column full_size">
+
        /** 清除内外边距 **/
−
<h1>Software</h1>
+
        body, h1, h3, h3, h4, h5, h6, hr, p, blockquote, /* structural elements 结构元素 */
−
</div>
+
        dl, dt, dd, ul, ol, li, /* list elements 列表元素 */
−
<div class="column two_thirds_size">
+
        pre, /* text formatting elements 文本格式元素 */
−
<h3>Best Software Tool Special Prize</h3>
+
        form, fieldset, legend, button, input, textarea, /* form elements 表单元素 */
−
<p>Regardless of the topic, iGEM projects often create or adapt computational tools to move the project forward. Because they are born out of a direct practical need, these software tools (or new computational methods) can be surprisingly useful for other teams. Without necessarily being big or complex, they can make the crucial difference to a project's success. This award tries to find and honor such "nuggets" of computational work.
+
        th, td /* table elements 表格元素 */ {
 +
            margin: 0;
 +
            padding: 0;
 +
        }
  
 +
        /** 设置默认字体 **/
  
−
<br><br>
+
        h1, h3, h3, h4, h5, h6 { font-size: 100%; }
−
To compete for the <a href="https://2018.igem.org/Judging/Awards">Best Software Tool prize</a>, please describe your work on this page and also fill out the description on the <a href="https://2018.igem.org/Judging/Judging_Form">judging form</a>.
+
        address, cite, dfn, em, var { font-style: normal; } /* 将斜体扶正 */
−
<br><br>
+
        code, kbd, pre, samp { font-family: courier new, courier, monospace; } /* 统一等宽字体 */
−
You must also delete the message box on the top of this page to be eligible for this prize.
+
        small { font-size: 12px; } /* 小于 12px 的中文很难阅读，让 small 正常化 */
−
</p>
+
  
 +
        /** 重置列表元素 **/
 +
        ul, ol { list-style: none; }
  
−
</div>
+
        /** 重置文本格式元素 **/
 +
        a { text-decoration: none; }
 +
        a:hover { text-decoration: underline; }
  
−
<div class="column third_size">
+
 
−
<div class="highlight decoration_A_full">
+
        /** 重置表单元素 **/
−
<h3> Inspiration </h3>
+
        legend { color: #000; } /* for ie6 */
−
<p>
+
        fieldset, img { border: 0; } /* img 搭车：让链接里的 img 无边框 */
−
Here are a few examples from previous teams:
+
        button, input, select, textarea { font-size: 100%; } /* 使得表单元素在 ie 下能继承字体大小 */
−
</p>
+
        /* 注：optgroup 无法扶正 */
−
<ul>
+
 
−
<li><a href="https://2016.igem.org/Team:BostonU_HW">2016 BostonU HW</a></li>
+
        /** 重置表格元素 **/
−
<li><a href="https://2016.igem.org/Team:Valencia_UPV">2016 Valencia UPV</a></li>
+
        table { border-collapse: collapse; border-spacing: 0; }
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:Heidelberg/Software">2014 Heidelberg</a></li>
+
        #FudanBody .imgNoM img{
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:Aachen/Project/Measurement_Device#Software">2014 Aachen</a></li>
+
            width:100%;
−
</ul>
+
        }
−
</div>
+
        #FudanBody .imgNoM{
 +
            text-align:center;
 +
        }
 +
    </style>
 +
</head>
 +
 
 +
<body>
 +
<!-- Fudan div at igem.org -->
 +
<div id="FudanWrapper" class="white">
 +
    <div id="FudanBody" class="white">
 +
        <header>
 +
            <!-- empty bar -->
 +
            <div id="emptyBar" style="position:relative;width: 100%;"></div>
 +
 
 +
            <!-- Navigation bar -->
 +
            <nav id="topNav" class="white z-depth-0_5">
 +
                <div class="nav-wrapper">
 +
                    <div id="teamLogo" class="brand-logo">
 +
                        <a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan" target="_self"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/c/c4/T--Fudan--teamLogo.svg"></a>
 +
                    </div>
 +
                    <ul id="nav-mobile" class="right orangeBorder">
 +
                        <li class="hide-on-med-and-down"><a class="dropdown-trigger" data-target="dropdown1">Project</a></li>
 +
                        <li class="hide-on-med-and-down"><a class="dropdown-trigger thisPageLink" data-target="dropdown2">Dry lab</a></li>
 +
                        <li class="hide-on-med-and-down"><a class="dropdown-trigger" data-target="dropdown3">Wet lab</a></li>
 +
                        <li class="hide-on-med-and-down"><a class="dropdown-trigger" data-target="dropdown4">Toolbox</a></li>
 +
                        <li class="hide-on-med-and-down"><a class="dropdown-trigger" data-target="dropdown5">Outreach</a></li>
 +
                        <li class="hide-on-med-and-down"><a class="dropdown-trigger" data-target="dropdown6">Team</a></li>
 +
                        <li>
 +
                            <a id="navList" data-target="slide-out" class="waves-effect waves-light sidenav-trigger right">
 +
                                <i class="fa fa-navicon" style="font-size: 24px"></i>
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                    </ul>
 +
                </div>
 +
            </nav>
 +
 
 +
            <!-- Dropdown and List elements in navigation bar -->
 +
            <ul id="dropdown1" class="dropdown-content">
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Demonstrate">Demonstration</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Antigen_Receptors">Antigen, Receptors</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Results">Transmembrane logic</a></li>
 +
            </ul>
 +
            <ul id="dropdown2" class="dropdown-content">
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Addon#ribo">Addon: ribo</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Addon#TALE">Addon: TALE</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Addon#T2">Addon: T2</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Model#Transcriptional_Amplifer">Model: transcriptional amplifer</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Model#War_Predictor">Model: war&nbsp;predictor</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Software">Software</a></li>
 +
            </ul>
 +
            <ul id="dropdown3" class="dropdown-content">
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/InterLab">iGEM interLab</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Notebook">Our notebook</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Primers">Primers used</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Protocols">Protocols</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Safety">Safety</a></li>
 +
            </ul>
 +
            <ul id="dropdown4" class="dropdown-content">
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Basic_Parts">Basic parts</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Composite_Parts">Composite parts</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Optimization">Optimization</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Parts_Collection">Parts collection</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Improve">Parts improvement</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Measurement">Quantification</a></li>
 +
            </ul>
 +
            <ul id="dropdown5" class="dropdown-content">
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Bio-Art">Bio-Art display</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Collaborations">Collaborations</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Design_Intention">Design intention</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Human_Practices">Human practices</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Public_Engagement">Public engagement</a></li>
 +
            </ul>
 +
            <ul id="dropdown6" class="dropdown-content">
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Acknowledgement">Acknowledgement</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Attributions">Attributions</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Heritage">Heritage</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Team">Members</a></li>
 +
                <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Sponsors">Sponsors</a></li>
 +
            </ul>
 +
 
 +
            <!-- Slide-out navigator contents -->
 +
            <ul id="slide-out" class="sidenav">
 +
                <li style="padding: 0"><div class="sidenavBanner">
 +
                    <div class="background orangeBg">
 +
                    </div>
 +
                    <p style="width: 100%;text-align: center;font-size: 24px"><span class="white-text">Software</span></p>
 +
                </div></li>
 +
                <li>
 +
                    <ul class="collapsible expandable">
 +
                        <li>Navigator on this page</li>
 +
                        <li class="onThisPageNav"><a href="#section1">xxx</a></li>
 +
                        <li>Navigator on wiki</li>
 +
                        <li>
 +
                            <div class="collapsible-header">Project</div>
 +
                            <div class="collapsible-body">
 +
                                <ul>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Demonstrate">Demonstration</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Antigen_Receptors">Antigen, Receptors</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Results">Transmembrane logic</a></li>
 +
                                </ul>
 +
                            </div>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <div class="collapsible-header">Dry Lab</div>
 +
                            <div class="collapsible-body">
 +
                                <ul>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Addon#ribo">Addon: ribo</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Addon#TALE">Addon: TALE</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Addon#T2">Addon: T2</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Model#Transcriptional_Amplifer">Model: transcriptional amplifer</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Model#War_Predictor">Model: war&nbsp;predictor</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Software">Software</a></li>
 +
                                </ul>
 +
                            </div>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <div class="collapsible-header">Wet Lab</div>
 +
                            <div class="collapsible-body">
 +
                                <ul>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/InterLab">iGEM interLab</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Notebook">Our notebook</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Primers">Primers used</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Protocols">Protocols</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Safety">Safety</a></li>
 +
                                </ul>
 +
                            </div>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <div class="collapsible-header">Toolbox</div>
 +
                            <div class="collapsible-body">
 +
                                <ul>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Basic_Parts">Basic parts</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Composite_Parts">Composite parts</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Optimization">Optimization</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Parts_Collection">Parts collection</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Improve">Parts improvement</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Measurement">Quantification</a></li>
 +
                                </ul>
 +
                            </div>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <div class="collapsible-header">Outreach</div>
 +
                            <div class="collapsible-body">
 +
                                <ul>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Bio-Art">Bio-Art display</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Collaborations">Collaborations</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Design_Intention">Design intention</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Human_Practices">Human practices</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Public_Engagement">Public engagement</a></li>
 +
                                </ul>
 +
                            </div>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <div class="collapsible-header">Team</div>
 +
                            <div class="collapsible-body">
 +
                                <ul>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Acknowledgement">Acknowledgement</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Attributions">Attributions</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Heritage">Heritage</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Team">Members</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Sponsors">Sponsors</a></li>
 +
                                </ul>
 +
                            </div>
 +
                        </li>
 +
                    </ul>
 +
 
 +
                </li>
 +
                <li><div class="placeHolder"></div></li>
 +
            </ul>
 +
        </header>
 +
 
 +
        <div id="pageContent" style="">
 +
 
 +
 
 +
            <div id="contentBanner" class="figureBanner orangeBg">
 +
                <div class="row">
 +
                    <div class="col s12 hide-on-med-and-up">
 +
                        <h1>Software</h1>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="col s12 hide-on-med-and-up">
 +
                        <span>...</span>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
                <div id="figureBannerTitle" class="hide-on-small-only">
 +
                    <h1>Software</h1>
 +
                    <p><span>...</span></p>
 +
                </div>
 +
                <div class="hide-on-small-only">
 +
                    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/2/26/T--Fudan--title_software.jpg">
 +
                    <svg width="10" height="10" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" style="position:absolute; left:0;top:0; width: 4%;height: 100%;">
 +
                        <defs>
 +
                            <linearGradient y2="0%" x2="100%" y1="0%" x1="0%" id="blackgraleft">
 +
                                <stop stop-color="rgb(0,0,0)" stop-opacity="1" offset="0%"/>
 +
                                <stop stop-color="rgb(0,0,0)" stop-opacity="0" offset="100%"/>
 +
                            </linearGradient>
 +
                        </defs>
 +
                        <g>
 +
                            <rect id="svg_1" fill="url(#blackgraleft)" height="100%" width="100%"/>
 +
                        </g>
 +
                    </svg>
 +
                    <svg width="10" height="10" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" style="position:absolute; right:0;top:0; width: 4%;height: 100%;">
 +
                        <defs>
 +
                            <linearGradient y2="0%" x2="100%" y1="0%" x1="0%" id="blackgraright">
 +
                                <stop stop-color="rgb(0,0,0)" stop-opacity="0" offset="0%"/>
 +
                                <stop stop-color="rgb(0,0,0)" stop-opacity="1" offset="100%"/>
 +
                            </linearGradient>
 +
                        </defs>
 +
                        <g>
 +
                            <rect id="svg_2" fill="url(#blackgraright)" height="100%" width="100%"/>
 +
                        </g>
 +
                    </svg>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
 
 +
            <!-- @@@@ main content of the page -->
 +
            <div class="container">
 +
                <!-- side navigator of page content -->
 +
                <ul id="pageContentNav" class="hide-on-med-and-down z-depth-0">
 +
                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Addon#ribo">Addon: ribo</a></li>
 +
                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Addon#TALE">Addon: TALE</a></li>
 +
                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Addon#T2">Addon: T2</a></li>
 +
                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Model#Transcriptional_Amplifer">Model: transcriptional amplifer</a></li>
 +
                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Model#War_Predictor">Model: war&nbsp;predictor</a></li>
 +
                    <li>Software</li>
 +
                    <li class="onThisPageNav"><a href="#section1">xxx</a></li>
 +
                </ul>
 +
                <main>
 +
                    <div id="section1" class="section container scrollspy">
 +
                    </div>
 +
                </main>
 +
            </div>
 +
            <!-- @@@@ end of main content of the page -->
 +
 
 +
            <!--Abstract on content page-->
 +
            <div id="abstractContent" class="z-depth-2">
 +
                <a href="#!"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/9/96/T--Fudan--X.svg"></a>
 +
                <div class="container">
 +
                    <h2 style="margin: 0;padding: 10px 0;">Abstract</h2>
 +
                    <p style="margin: 0">Contact-dependent signaling is critical for multicellular biological
 +
                        events, yet customizing contact-dependent signal transduction between
 +
                        cells remains challenging. Here we have developed the ENABLE toolbox, a
 +
                        complete set of transmembrane binary logic gates. Each gate consists of
 +
                        3 layers: Receptor, Amplifier, and Combiner. We first optimized synthetic
 +
                        Notch receptors to enable cells to respond to different signals across the
 +
                        membrane reliably. These signals, individually amplified intracellularly by
 +
                        transcription, are further combined for computing. Our engineered zinc finger-based
 +
                        transcription factors perform binary computation and output designed products.
 +
                        In summary, we have combined spatially different signals in mammalian cells,
 +
                        and revealed new potentials for biological oscillators, tissue engineering,
 +
                        cancer treatments, bio-computing, etc. ENABLE is a toolbox for constructing
 +
                        contact-dependent signaling networks in mammals. The 3-layer design principle
 +
                        underlying ENABLE empowers any future development of transmembrane logic circuits,
 +
                        thus contributes a foundational advance to Synthetic Biology.
 +
                    </p>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
 
 +
            <!-- Floating Btns -->
 +
            <div class="floatingBtn">
 +
                <a href="#!" id="abstractBtn" class="btn">
 +
                    <i class="fa fa-sticky-note" style="font-size: 30px;line-height: 50px"></i>
 +
                </a>
 +
                <a href="#FudanWrapper" class="btn">
 +
                    <i class="fa fa-angle-up" style="font-size: 48px;line-height: 45px"></i>
 +
                </a>
 +
            </div>
 +
 
 +
            <!-- Footer with sponsors and contact methods -->
 +
            <footer id="FudanFooter" class="page-footer grey">
 +
                <div class="container">
 +
                    <div class="row">
 +
                        <div id="sponsor" class="col m3 s12 row">
 +
                            <a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan" target="_blank"><img class="col s3 m6 l3" style="position:relative; padding: 0 0.3rem; margin:-0.15rem 0; left: -0.45rem;" src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/7/73/T--Fudan--teamLogoWhite.png">
 +
                            </a><a href="http://www.fudan.edu.cn/en/" target="_blank"><img class="col s3 m6 l3" alt="Fudan University" src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/f/f7/T--Fudan--schoolLogo.png">
 +
                        </a><a href="http://life.fudan.edu.cn/" target="_blank"><img class="col s3 m6 l3" style="margin-bottom: 4%;/* 该图比其他小一点，排版需要 */" alt="School of Life Sciences, Fudan University" src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/1/1d/T--Fudan--schoolOfLifeSciencesIcon.png">
 +
                        </a><a href="http://www.yfc.cn/en/" target="_blank"><img class="col s3 m6 l3" style="padding: 0.15rem 0.9rem;" alt="Yunfeng Capital" src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/e/e2/T--Fudan--yunfengLogo.png">
 +
                        </a>
 +
                            <h3 class="col s12" style="text-align: left; color: rgba(255, 255, 255, 0.8); font-size: 18px">ENABLE: making cells even smarter</h3>
 +
                        </div>
 +
                        <div id="usefulLinks" class="col m9 s12 row">
 +
                            <div class="col s12 l6 row">
 +
                                <div class="col s12 m4">
 +
                                    <span>Project</span>
 +
                                    <ul>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Demonstrate">Demonstration</a></li>
 +
 
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Antigen_Receptors">Antigen, Receptors</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Results">Transmembrane logic</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2017.igem.org/Team:Fudan">2017.iGEM</a></li>
 +
                                    </ul>
 +
                                </div>
 +
                                <div class="col s12 m4 active">
 +
                                    <span>Dry lab</span>
 +
                                    <ul>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Addon#ribo">Addon: ribo</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Addon#TALE">Addon: TALE</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Addon#T2">Addon: T2</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Model#Transcriptional_Amplifer">Model: transcriptional amplifer</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Model#War_Predictor">Model: war&nbsp;predictor</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Software">Software</a></li>
 +
                                    </ul>
 +
                                </div>
 +
                                <div class="col s12 m4">
 +
                                    <span>Wet lab</span>
 +
                                    <ul>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/InterLab">iGEM interLab</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Notebook">Our notebook</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Primers">Primers used</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Protocols">Protocols</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Safety">Safety</a></li>
 +
                                    </ul>
 +
                                </div>
 +
                            </div>
 +
                            <div class="col s12 l6 row">
 +
                                <div class="col s12 m4">
 +
                                    <span>Toolbox</span>
 +
                                    <ul>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Basic_Parts">Basic parts</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Composite_Parts">Composite parts</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Optimization">Optimization</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Parts_Collection">Parts collection</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Improve">Parts improvement</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Measurement">Quantification</a></li>
 +
                                    </ul>
 +
                                </div>
 +
                                <div class="col s12 m4">
 +
                                    <span>Outreach</span>
 +
                                    <ul>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Bio-Art">Bio-Art display</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Collaborations">Collaborations</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Design_Intention">Design intention</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Human_Practices">Human practices</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Public_Engagement">Public engagement</a></li>
 +
                                    </ul>
 +
                                </div>
 +
                                <div class="col s12 m4">
 +
                                    <span>Team</span>
 +
                                    <ul>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Acknowledgement">Acknowledgement</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Attributions">Attributions</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Heritage">Heritage</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Team">Members</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan/Sponsors">Sponsors</a></li>
 +
                                    </ul>
 +
                                </div>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
                <div class="footer-copyright">
 +
                    <div class="container">
 +
                        <div class="contactUS row">
 +
                            <div class="col s12 m6 l4"><i class="fa fa-location-arrow"></i> Life Sci Bldg E301, 2005 Songhu Rd, Shanghai
 +
                            </div><div class="col s12 m6 l3"><i class="fa fa-envelope-o"></i> igem@fudan.edu.cn
 +
                        </div><div class="col s12 m6 l2"><i class="fa fa-wechat"></i> Fudan_iGEM
 +
                        </div><div class="col s12 m6 l3"><i class="fa fa-fax"></i> +86-21-31246727
 +
                        </div>
 +
                        </div>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </footer>
 +
 
 +
        </div>
 +
    </div>
 
</div>
 
</div>
  
 +
 +
<!-- Javascript files -->
 +
<!-- Materialize 1.0.0-rc.2 -->
 +
<script src="https://2018.igem.org/wiki/index.php?title=Template:Fudan/materialize.js&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
 +
<!-- Javascript -->
 +
<script src="https://2018.igem.org/wiki/index.php?title=Template:Fudan/js.js&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
 +
</body>
 
</html>
 
</html>

Revision as of 13:03, 17 October 2018

Software

...

Software

...

Abstract

Contact-dependent signaling is critical for multicellular biological events, yet customizing contact-dependent signal transduction between cells remains challenging. Here we have developed the ENABLE toolbox, a complete set of transmembrane binary logic gates. Each gate consists of 3 layers: Receptor, Amplifier, and Combiner. We first optimized synthetic Notch receptors to enable cells to respond to different signals across the membrane reliably. These signals, individually amplified intracellularly by transcription, are further combined for computing. Our engineered zinc finger-based transcription factors perform binary computation and output designed products. In summary, we have combined spatially different signals in mammalian cells, and revealed new potentials for biological oscillators, tissue engineering, cancer treatments, bio-computing, etc. ENABLE is a toolbox for constructing contact-dependent signaling networks in mammals. The 3-layer design principle underlying ENABLE empowers any future development of transmembrane logic circuits, thus contributes a foundational advance to Synthetic Biology.