Difference between revisions of "Team:TecCEM/Experiments"

 
(35 intermediate revisions by 3 users not shown)
Line 1: Line 1:
 
{{TecCEM}}
 
{{TecCEM}}
 
<html>
 
<html>
 +
<style>
 +
    .wrapper .sidebar-index {
 +
            overflow: auto;
 +
        }
 +
    </style>
 
<div id="gif-title" class="text-project">
 
<div id="gif-title" class="text-project">
−
     <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/a/aa/T--TecCEM--Cells.gif" alt="Cell Gif">
+
     <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/4/41/T--TecCEM--Cells--Experiments.gif" alt="Cell Gif">
 
     <h1>Experiments</h1>
 
     <h1>Experiments</h1>
 
</div>
 
</div>
Line 10: Line 15:
 
             <h3>Project/ Experiments</h3>
 
             <h3>Project/ Experiments</h3>
 
         </div>
 
         </div>
−
         <a href="#experimentsSubmenu" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-offset="100" data-change="sidemenu">
+
         <a href="#experimentsSubmenu" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-change="sidemenu">
 
             <span data-change="el" class="d-inline-block open"></span>
 
             <span data-change="el" class="d-inline-block open"></span>
 
             Index
 
             Index
Line 16: Line 21:
 
         <ul class="collapse list-unstyled" id="experimentsSubmenu">
 
         <ul class="collapse list-unstyled" id="experimentsSubmenu">
 
             <li class="active">
 
             <li class="active">
−
                 <a data-target="#description">Description</a>
+
                 <a>Description</a>
 
             </li>
 
             </li>
 +
 
             <li>
 
             <li>
−
                 <a href="#protocolsSubmenu" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-offset="100" data-change="sidemenu">
+
                 <a href="#proteinSubmenu" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-change="sidemenu">
−
                     <span class="d-inline-block open" data-change="el"></span>
+
                     <span class="d-inline-bock open" data-change="el"></span>
−
                     Protocols
+
                     Protein
 
                 </a>
 
                 </a>
−
                 <ul class="collapse list-unstyled" id="protocolsSubmenu">
+
                 <ul class="collapse list-unstyled" id="proteinSubmenu">
 
                     <li>
 
                     <li>
−
                         <a href="#chitosanSubmenu" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-offset="100"
+
                         <a href="#chitosan" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-change="sidemenu">
−
                            data-change="sidemenu">
+
 
                             <span class="d-inline-bock open" data-change="el"></span>
 
                             <span class="d-inline-bock open" data-change="el"></span>
−
                             Chitosan nanoparticles
+
                             Chitosan
 
                         </a>
 
                         </a>
−
                         <ul class="collapse list-unstyled" id="chitosanSubmenu">
+
                         <ul class="collapse list-unstyled" id="chitosan">
−
                             <li class="active">
+
                             <li>
−
                                 <a data-target="#encapsulation">Protein encapsulation protocol</a>
+
                                 <a>Protein encapsulation protocol</a>
 
                             </li>
 
                             </li>
−
                             <li class="active">
+
                             <li>
−
                                 <a data-target="#encapsulation-efficiency">Protein encapsulation efficiency protocol</a>
+
                                 <a>Protein encapsulation efficiency
 +
                                    protocol</a>
 
                             </li>
 
                             </li>
−
                             <li class="active">
+
                             <li>
−
                                 <a data-target="#liberation-and-stability">Protein liberation and stability protocol</a>
+
                                <a>Protein liberation and stability
 +
                                    protocol</a>
 +
                            </li>
 +
                        </ul>
 +
                    </li>
 +
                    <li>
 +
                        <a href="#polyacrimlamide-gel" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-change="sidemenu">
 +
                            <span class="d-inline-bock open" data-change="el"></span>
 +
                            Polyacrilamide gel
 +
                        </a>
 +
                        <ul class="collapse list-unstyled" id="polyacrimlamide-gel">
 +
                            <li>
 +
                                 <a>AB Polyacrilamide gel</a>
 +
                            </li>
 +
                            <li>
 +
                                <a>Standard polyacrylamide gel</a>
 +
                            </li>
 +
                        </ul>
 +
                    </li>
 +
                    <li>
 +
                        <a href="#productpurification" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-change="sidemenu">
 +
                            <span class="d-inline-bock open" data-change="el"></span>
 +
                            Production/purification
 +
                        </a>
 +
                        <ul class="collapse list-unstyled" id="productpurification">
 +
                            <li>
 +
                                <a>Criofracture</a>
 +
                            </li>
 +
                            <li>
 +
                                <a>Fluorescent protein production</a>
 +
                            </li>
 +
                            <li>
 +
                                <a>Protein production/purification
 +
                                    protocol</a>
 +
                            </li>
 +
                        </ul>
 +
                    </li>
 +
                    <li>
 +
                        <a href="#proteicquantification" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-change="sidemenu">
 +
                            <span class="d-inline-bock open" data-change="el"></span>
 +
                            Proteic quantification
 +
                        </a>
 +
                        <ul class="collapse list-unstyled" id="proteicquantification">
 +
                            <li>
 +
                                <a>Bradford</a>
 +
                            </li>
 +
                            <li>
 +
                                <a>Lowry</a>
 +
                            </li>
 +
                            <li>
 +
                                <a>Pierce BCA</a>
 +
                            </li>
 +
                        </ul>
 +
                    </li>
 +
                </ul>
 +
            </li>
 +
            <li>
 +
                <a href="#cellSubmenu" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-change="sidemenu">
 +
                    <span class="d-inline-bock open" data-change="el"></span>
 +
                    Cell
 +
                </a>
 +
                <ul class="collapse list-unstyled" id="cellSubmenu">
 +
                    <li>
 +
                        <a>In vitro burn essay protocol</a>
 +
                    </li>
 +
                </ul>
 +
            </li>
 +
            <li>
 +
                <a href="#reactantsSubmenu" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-change="sidemenu">
 +
                    <span class="d-inline-bock open" data-change="el"></span>
 +
                    Reactants
 +
                </a>
 +
                <ul class="collapse list-unstyled" id="reactantsSubmenu">
 +
                    <li>
 +
                        <a>Protocol for the creation of lysis buffer P</a>
 +
                    </li>
 +
                    <li>
 +
                        <a>Protocol for the creation of polyacrylamide gel</a>
 +
                    </li>
 +
                    <li>
 +
                        <a>Protocol for the creation of thermal lysis buffer</a>
 +
                    </li>
 +
                    <li>
 +
                        <a>Protocol to make polyacrylamide AB</a>
 +
                    </li>
 +
                </ul>
 +
            </li>
 +
            <li>
 +
                <a href="#nucleicSubmenu" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-change="sidemenu">
 +
                    <span class="d-inline-bock open" data-change="el"></span>
 +
                    Nucleic Acids
 +
                </a>
 +
                <ul class="collapse list-unstyled" id="nucleicSubmenu">
 +
                    <li>
 +
                        <a href="#celltransformation" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-change="sidemenu">
 +
                            <span class="d-inline-bock open" data-change="el"></span>
 +
                            Cell Transformation
 +
                        </a>
 +
                        <ul class="collapse list-unstyled" id="celltransformation">
 +
                            <li>
 +
                                <a>Chemocompetent cells transformation protocol</a>
 +
                            </li>
 +
                            <li>
 +
                                <a>Protocol for chemocompetent cells</a>
 +
                            </li>
 +
                            <li>
 +
                                <a>Thermal Shock cell transformation protocol</a>
 +
                            </li>
 +
                        </ul>
 +
                    </li>
 +
                    <li>
 +
                        <a href="#enzymerestriction" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-change="sidemenu">
 +
                            <span class="d-inline-bock open" data-change="el"></span>
 +
                            Enzyme restriction
 +
                        </a>
 +
                        <ul class="collapse list-unstyled" id="enzymerestriction">
 +
                            <li>
 +
                                <a>Protocol for enzyme digestion/alkaline phosphatase treatment
 +
                                    of iGEM plasmids and ligation</a>
 +
                            </li>
 +
                            <li>
 +
                                <a>Protocol for enzyme ligation of iGEM parts</a>
 +
                            </li>
 +
                            <li>
 +
                                <a>Protocol for enzyme restriction of IDT parts and iGEM plasmid</a>
 +
                            </li>
 +
                        </ul>
 +
                    </li>
 +
                    <li>
 +
                        <a href="#pcr" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-change="sidemenu">
 +
                            <span class="d-inline-bock open" data-change="el"></span>
 +
                            PCR
 +
                        </a>
 +
                        <ul class="collapse list-unstyled" id="pcr">
 +
                            <li>
 +
                                <a>Protocol for Colony PCR</a>
 +
                            </li>
 +
                            <li>
 +
                                <a>Protocol for PCR using VR and VF2 primers</a>
 +
                            </li>
 +
                        </ul>
 +
                    </li>
 +
                    <li>
 +
                        <a href="#plasmidextraction" data-toggle="collapse" aria-expanded="false" data-change="sidemenu">
 +
                            <span class="d-inline-bock open" data-change="el"></span>
 +
                            Plasmid extraction
 +
                        </a>
 +
                        <ul class="collapse list-unstyled" id="plasmidextraction">
 +
                            <li>
 +
                                <a>Agarose Band purification (GenElute - Sigma)</a>
 +
                            </li>
 +
                            <li>
 +
                                <a>Alkaline plasmid purification protocol</a>
 +
                            </li>
 +
                            <li>
 +
                                <a>MiniPrep Sigma extraction protocol</a>
 
                             </li>
 
                             </li>
 
                         </ul>
 
                         </ul>
Line 50: Line 211:
 
             <div class="row">
 
             <div class="row">
 
                 <div class="col">
 
                 <div class="col">
−
                     <p>Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Donec eu orci non felis suscipit
+
                     <p>This is our experiment section. Here we compile important protocols for the development of
−
                         viverra id
+
                         TecTissue, ranging from our bacterial transformation procedures to our cell proliferation
−
                        et
+
                         assays.
−
                        metus. In quis nunc eget ligula tincidunt placerat. Integer pulvinar nisi a erat porttitor, in
+
                         We also address cell culture maintenance and protein loaded chitosan nanoparticles.
−
                         tempus
+
                         Here you may find the protocol for our growth factor delivery to damaged cells and how much
−
                        lectus consectetur. Donec eget mi aliquet, vulputate risus in, dignissim ligula. Vivamus sit
+
                         harm can be inflicted in vitro.
−
                         amet
+
−
                        ornare felis. Nunc imperdiet rutrum dui quis porttitor. Nulla eget risus arcu. Morbi placerat
+
−
                         aliquet
+
−
                         nisl, id semper neque lobortis et. Aenean ullamcorper turpis in massa lobortis rutrum. Proin
+
−
                        viverra,
+
−
                        nulla id aliquet molestie, justo justo finibus augue, in ullamcorper nisl libero ut nisl.
+
−
                        Quisque
+
−
                        imperdiet luctus ipsum nec porta. Vivamus et ex id nunc porttitor laoreet.
+
 
                     </p>
 
                     </p>
 
                 </div>
 
                 </div>
Line 69: Line 222:
 
         </div>
 
         </div>
 
         <div class="container mt-3">
 
         <div class="container mt-3">
 +
            <h1>Protein</h1>
 +
            <h2>Chitosan nanoparticles</h2>
 
             <div class="row">
 
             <div class="row">
 
                 <div class="col">
 
                 <div class="col">
−
                     <h1>Protocols</h1>
+
                     <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#encapsulation" role="button"
−
                     <h2>Chitosan nanoparticles</h2>
+
                        aria-expanded="false" aria-controls="encapsulation">
−
                     <h3 id="encapsulation">Protein encapsulation protocol</h3>
+
                        <h3>Protein encapsulation protocol</h3>
−
                     <p>
+
                     </a>
−
                         Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Donec eu orci non felis suscipit
+
                    <div class="collapse" id="encapsulation">
−
                         viverra id
+
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/0/02/T--TecCEM--Experiments-Proteins2.pdf"
−
                         et
+
                            width="100%" height="900px">
−
                         metus. In quis nunc eget ligula tincidunt placerat. Integer pulvinar nisi a erat porttitor, in
+
                        </object>
−
                         tempus
+
                    </div>
−
                         lectus consectetur. Donec eget mi aliquet, vulputate risus in, dignissim ligula. Vivamus sit
+
                </div>
−
                         amet
+
            </div>
−
                         ornare felis. Nunc imperdiet rutrum dui quis porttitor. Nulla eget risus arcu. Morbi placerat
+
            <div class="row">
−
                         aliquet
+
                <div class="col">
−
                         nisl, id semper neque lobortis et. Aenean ullamcorper turpis in massa lobortis rutrum. Proin
+
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#encapsulation-efficiency" role="button"
−
                         viverra,
+
                        aria-expanded="false" aria-controls="encapsulation-efficiency">
−
                         nulla id aliquet molestie, justo justo finibus augue, in ullamcorper nisl libero ut nisl.
+
                        <h3>Protein encapsulation efficiency protocol</h3>
−
                         Quisque
+
                    </a>
−
                         imperdiet luctus ipsum nec porta. Vivamus et ex id nunc porttitor laoreet.
+
                    <div class="collapse" id="encapsulation-efficiency">
−
                     </p>
+
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/6/62/T--TecCEM--Experiments-Proteins1.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#liberation-and-stability" role="button"
 +
                        aria-expanded="false" aria-controls="liberation-and-stability">
 +
                        <h3>Protein liberation and stability protocol</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="liberation-and-stability">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/2/23/T--TecCEM--Experiments-Proteins3.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <h2>Polyacrylamide gel</h2>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                     <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#abpolyacrilamidegel" role="button"
 +
                        aria-expanded="false" aria-controls="abpolyacrilamidegel">
 +
                        <h3>AB Polyacrilamide gel</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="abpolyacrilamidegel">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/5/5d/T--TecCEM--Experiments-Proteins4.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#stdpolyacrilamidegeel" role="button"
 +
                        aria-expanded="false" aria-controls="stdpolyacrilamidegeel">
 +
                        <h3>Standard polyacrylamide gel</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="stdpolyacrilamidegeel">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/2/2c/T--TecCEM--Experiments-Proteins5.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <h2>Production/purification</h2>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#criofracture" role="button"
 +
                        aria-expanded="false" aria-controls="criofracture">
 +
                        <h3>Criofracture</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="criofracture">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/7/79/T--TecCEM--Experiments-Proteins6.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#fluorescentproteinproduction" role="button"
 +
                        aria-expanded="false" aria-controls="fluorescentproteinproduction">
 +
                        <h3>Fluorescent protein production</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="fluorescentproteinproduction">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/7/74/T--TecCEM--Experiments-Proteins7.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#proteinproductionpurificationprotocol"
 +
                        role="button" aria-expanded="false" aria-controls="proteinproductionpurificationprotocol">
 +
                        <h3>Protein production/purification
 +
                            protocol</h3>
 +
                     </a>
 +
                    <div class="collapse" id="proteinproductionpurificationprotocol">
 +
                         <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/e/e9/T--TecCEM--Experiments-Proteins8.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                         </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <h2>Proteic quantification</h2>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#bradford" role="button"
 +
                        aria-expanded="false" aria-controls="bradford">
 +
                        <h3>Bradford</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="bradford">
 +
                         <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/f/f9/T--TecCEM--Experiments-Proteins9.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                         </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#lowry" role="button" aria-expanded="false"
 +
                        aria-controls="lowry">
 +
                        <h3>Lowry</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="lowry">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/9/90/T--TecCEM--Experiments-Proteins10.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#piercebca" role="button"
 +
                        aria-expanded="false" aria-controls="piercebca">
 +
                        <h3>Pierce BCA</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="piercebca">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/a/af/T--TecCEM--Experiments-Proteins11.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
        </div>
 +
        <div class="container mt-3">
 +
            <h1>Cells</h1>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#cellessay" role="button"
 +
                        aria-expanded="false" aria-controls="cellessay">
 +
                        <h3>In vitro burn essay protocol</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="cellessay">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/6/66/T--TecCEM--Experiments-Cells.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
        </div>
 +
        <div class="container mt-3">
 +
            <h1>Reactants</h1>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#creationlysisbbuffer" role="button"
 +
                         aria-expanded="false" aria-controls="creationlysisbbuffer">
 +
                         <h3>Protocol for the creation of lysis buffer P</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="creationlysisbbuffer">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/e/e9/T--TecCEM--Experiments-Reactants1.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                         </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#creationpolyacrylamidegel" role="button"
 +
                         aria-expanded="false" aria-controls="creationpolyacrylamidegel">
 +
                        <h3>Protocol for the creation of polyacrylamide gel</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="creationpolyacrylamidegel">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/c/c1/T--TecCEM--Experiments-Reactants2.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                         </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#creationthemlysisbuffer" role="button"
 +
                         aria-expanded="false" aria-controls="creationthemlysisbuffer">
 +
                        <h3>Protocol for the creation of thermal lysis buffer</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="creationthemlysisbuffer">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/2/21/T--TecCEM--Experiments-Reactants3.pdf"
 +
                            width="
 +
                            100%" height="900px">
 +
                         </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#creationpolyacrylamideab" role="button"
 +
                         aria-expanded="false" aria-controls="creationpolyacrylamideab">
 +
                        <h3>Protocol to make polyacrylamide AB</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="creationpolyacrylamideab">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/1/19/T--TecCEM--Experiments-Reactants4.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                         </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
        </div>
 +
        <div class="container mt-3">
 +
            <h1>Nucleic acids</h1>
 +
            <h2>Cell transformation</h2>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#chemocompetentcells" role="button"
 +
                         aria-expanded="false" aria-controls="chemocompetentcells">
 +
                        <h3>Chemocompetent cells transformation protocol</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="chemocompetentcells">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/f/fe/T--TecCEM--Experiments-NucleicAcids1.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#pcc" role="button" aria-expanded="false"
 +
                        aria-controls="pcc">
 +
                        <h3>Protocol for chemocompetent cells</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="pcc">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/7/77/T--TecCEM--Experiments-NucleicAcids2.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#tsc" role="button" aria-expanded="false"
 +
                        aria-controls="tsc">
 +
                        <h3>Thermal Shock cell transformation protocol</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="tsc">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/5/58/T--TecCEM--Experiments-NucleicAcids3.pdf"
 +
                            width="
 +
                            100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <h2>Enzyme restriction</h2>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#ligacion" role="button"
 +
                        aria-expanded="false" aria-controls="ligacion">
 +
                        <h3>Protocol for enzyme digestion/alkaline phosphatase treatment of iGEM plasmids and ligation</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="ligacion">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/3/39/T--TecCEM--Experiments-NucleicAcids4.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#enzymelig" role="button"
 +
                        aria-expanded="false" aria-controls="enzymelig">
 +
                        <h3>Protocol for enzyme ligation of iGEM parts</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="enzymelig">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/b/bd/T--TecCEM--Experiments-NucleicAcids5.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#enzres" role="button" aria-expanded="false"
 +
                        aria-controls="enzres">
 +
                        <h3>Protocol for enzyme restriction of IDT parts and iGEM plasmid</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="enzres">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/8/84/T--TecCEM--Experiments-NucleicAcids6.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <h2>PCR</h2>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#protocolforcolonypcr" role="button"
 +
                        aria-expanded="false" aria-controls="protocolforcolonypcr">
 +
                        <h3>Protocol for Colony PCR</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="protocolforcolonypcr">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/e/eb/T--TecCEM--Experiments-NucleicAcids7.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#protocolforpcrvrvf2primers" role="button"
 +
                        aria-expanded="false" aria-controls="protocolforpcrvrvf2primers">
 +
                        <h3>Protocol for PCR using VR and VF2 primers</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="protocolforpcrvrvf2primers">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/3/3c/T--TecCEM--Experiments-NucleicAcids8.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <h2>Plasmid extraction</h2>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#agarosebandpurification" role="button"
 +
                        aria-expanded="false" aria-controls="agarosebandpurification">
 +
                        <h3>Agarose Band purification (GenElute - Sigma)</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="agarosebandpurification">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/4/44/T--TecCEM--Experiments-NucleicAcids9.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#alkalineplasmidpurification" role="button"
 +
                        aria-expanded="false" aria-controls="alkalineplasmidpurification">
 +
                        <h3>Alkaline plasmid purification protocol</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="alkalineplasmidpurification">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/e/e4/T--TecCEM--Experiments-NucleicAcids10.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="col">
 +
                    <a class="btn-link text-notebook" data-toggle="collapse" href="#miniprepsigma" role="button"
 +
                        aria-expanded="false" aria-controls="miniprepsigma">
 +
                        <h3>MiniPrep Sigma extraction protocol</h3>
 +
                    </a>
 +
                    <div class="collapse" id="miniprepsigma">
 +
                        <object type="application/pdf" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/1/17/T--TecCEM--Experiments-NucleicAcids11.pdf"
 +
                            width="100%" height="900px">
 +
                        </object>
 +
                     </div>
 
                 </div>
 
                 </div>
 
             </div>
 
             </div>

Latest revision as of 23:43, 17 October 2018

Cell Gif

Experiments

This is our experiment section. Here we compile important protocols for the development of TecTissue, ranging from our bacterial transformation procedures to our cell proliferation assays. We also address cell culture maintenance and protein loaded chitosan nanoparticles. Here you may find the protocol for our growth factor delivery to damaged cells and how much harm can be inflicted in vitro.

Protein

Chitosan nanoparticles

Polyacrylamide gel

Production/purification

Proteic quantification

Cells

Reactants

Nucleic acids

Cell transformation

Enzyme restriction

PCR

Plasmid extraction