Difference between revisions of "Team:Cornell/Parts"

 
(27 intermediate revisions by the same user not shown)
Line 29: Line 29:
 
             margin: 0;
 
             margin: 0;
 
         }
 
         }
 +
 +
        /* removes bullets from Toolkit dropdown menu */
 +
        ul {
 +
            list-style-image: none;
 +
        }
 +
 +
        .parts-page-content-section-last{
 +
            margin-left: auto;
 +
            margin-right: auto;
 +
            display: block;
 +
        }
 +
 
     </style>
 
     </style>
 
     <title>Team:Cornell - 2018.igem.org</title>
 
     <title>Team:Cornell - 2018.igem.org</title>
Line 39: Line 51:
 
</head>
 
</head>
 
     <body>
 
     <body>
−
        <!------------------------ NAV BAR START ------------------------>
+
      <div class="parts-page-wrapper standard-page-wrapper">
−
<div class="standard-page-wrapper">
+
 
 +
<!------------------------ NAV BAR START ------------------------>
 
         <nav>
 
         <nav>
 
             <div class="nav-bar-wrapper">
 
             <div class="nav-bar-wrapper">
 
                 <div>
 
                 <div>
 
                     <div class="nav-bar-logo">
 
                     <div class="nav-bar-logo">
−
                         <a href="home"><img src="images/new_oscillate_logo.png" alt="Oscillate"></a>
+
                         <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/a/af/T--Cornell--OscillateLogo.png" alt="Oscillate"></a>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="nav-bar-main-menu">
 
                     <div class="nav-bar-main-menu">
−
                        <div class="dropdown">
+
                    <div class="dropdown">
−
                            <button class="dropbtn">TEAM</button>
+
                        <button class="dropbtn">TEAM</button>
−
                            <div class="dropdown-content team-dropdown-content">
+
                        <div class="dropdown-content team-dropdown-content">
−
                                <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Team">BIOS</a>
+
                            <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Team">BIOS</a>
−
                                <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Sponsors">SPONSORS</a>
+
                            <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Sponsors">SPONSORS</a>
−
                                <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Attributions">ATTRIBUTIONS</a>
+
                            <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Attributions">ATTRIBUTIONS</a>
−
                            </div>
+
 
                         </div>
 
                         </div>
−
                        <div class="dropdown">
+
                    </div>
−
                            <button class="dropbtn">OUTREACH</button>
+
                    <div class="dropdown">
−
                            <div class="dropdown-content outreach-dropdown-content">
+
                        <button class="dropbtn">OUTREACH</button>
−
                                <a href="#">COLLABORATIONS</a>
+
                        <div class="dropdown-content outreach-dropdown-content">
−
                                <a href="#">PUBLIC ENGAGEMENT</a>
+
                            <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Collaborations">COLLABORATIONS</a>
−
                            </div>
+
                            <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Public_Engagement">PUBLIC ENGAGEMENT</a>
 
                         </div>
 
                         </div>
−
                        <div class="dropdown">
+
                    </div>
−
                            <button class="dropbtn">HUMAN-CENTERED DESIGN</button>
+
                    <div class="dropdown">
−
                            <div class="dropdown-content human-dropdown-content">
+
                        <button class="dropbtn">HUMAN-CENTERED DESIGN</button>
−
                                <a href="#">PRACTICES</a>
+
                        <div class="dropdown-content human-dropdown-content">
−
                                <a href="#">POLICIES</a>
+
                            <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Human_Practices">PRACTICES</a>
−
                                <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Entrepreneurship">ENTREPRENEURSHIP</a>
+
                            <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Policies">POLICIES</a>
−
                            </div>
+
                            <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Entrepreneurship">ENTREPRENEURSHIP</a>
 
                         </div>
 
                         </div>
−
                        <div class="dropdown">
+
                    </div>
−
                            <button class="dropbtn">MODELING</button>
+
                    <div class="dropdown">
−
                            <div class="dropdown-content modeling-dropdown-content">
+
                        <button class="dropbtn">MODELING</button>
−
                                <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Model">MODEL</a>
+
                        <div class="dropdown-content modeling-dropdown-content">
−
                                <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Software">SOFTWARE</a>
+
                            <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Model">MODELING</a>
−
                                <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Design">DESIGN</a>
+
                            <a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Testing">TESTING</a>
−
                            </div>
+
 
                         </div>
 
                         </div>
−
                        <div class="dropdown">
+
                    </div>
−
                            <button class="dropbtn">TOOLKIT</button>
+
                    <div class="dropdown">
−
                            <div class="dropdown-content toolkit-dropdown-content">
+
                        <button class="dropbtn active-page">TOOLKIT</button>
−
                                <ul>
+
                        <div class="dropdown-content toolkit-dropdown-content">
−
                                    <div class="nav-first-col">
+
                            <ul>
−
                                        <li class = "wet-lab-list-title"><b>WET LAB</b></li>
+
                                <div class="nav-first-col">
−
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Foundations">FOUNDATIONS</a></li>
+
                                    <li class = "wet-lab-list-title"><b>WET LAB</b></li>
−
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Demonstrate">DEMONSTRATE</a></li>
+
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Foundations">FOUNDATIONS</a></li>
−
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/InterLab">INTERLAB</a></li>
+
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Demonstrate">DEMONSTRATE</a></li>
−
                                        <li><a href="hhttps://2018.igem.org/Team:Cornell/Parts">PARTS</a></li>
+
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/InterLab">INTERLAB</a></li>
−
                                        </li>
+
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Parts">PARTS</a></li>
−
                                     </div>
+
                                     <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Basic_Part">BASIC PARTS</a></li>
−
 
+
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Composite_Part">COMPOSITE PARTS</a></li>
−
                                    <div class="nav-second-col">
+
                                    </li>
−
                                        <li class = "doc-list-title"><b>DOCUMENTATION</b></li>
+
                                </div>
−
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Notebook">NOTEBOOK</a></li>
+
                                 <div class="nav-second-col">
−
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Safety">SAFETY</a></li>
+
                                    <li class = "doc-list-title"><b>DOCUMENTATION</b></li>
−
                                        </li>
+
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Notebook">NOTEBOOK</a></li>
−
                                    </div>
+
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Cornell/Safety">SAFETY</a></li>
−
                                 </ul>
+
                                    </li>
−
                            </div>
+
                                </div>
−
                        </div>
+
                            </ul>
−
                        <div class="dropdown">
+
−
                            <button class="dropbtn" onclick="location.href='https://2018.igem.org/Team:Cornell/Description '">ABOUT</button>
+
−
                        </div>
+
−
                        <div class="dropdown">
+
−
                            <button class="dropbtn active-page" onclick="location.href='https://2018.igem.org/Team:Cornell'">HOME</button>
+
 
                         </div>
 
                         </div>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="dropdown">
 +
                        <button class="dropbtn" onclick="location.href='https://2018.igem.org/Team:Cornell/About'">ABOUT</button>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="dropdown">
 +
                        <button class="dropbtn" onclick="location.href='https://2018.igem.org/Team:Cornell'">HOME</button>
 
                     </div>
 
                     </div>
 +
                </div>
 
                 </div>
 
                 </div>
 
             </div>
 
             </div>
Line 113: Line 126:
 
         <!------------------------ NAV BAR END ------------------------>
 
         <!------------------------ NAV BAR END ------------------------>
  
−
        <!------------------------ WET LAB PAGE BANNER START ------------------------>
+
<!------------------------ WET LAB PAGE BANNER START ------------------------>
−
         <header class="standard-page-banner">           
+
         <header class="parts-page-banner standard-page-banner">           
 
             <svg viewBox="0 0 100 100" width=100% height=100%>
 
             <svg viewBox="0 0 100 100" width=100% height=100%>
 
                 <polygon points="-50,50 50,10 150,50 50,90" fill="white" fill-opacity="0.4"></polygon>
 
                 <polygon points="-50,50 50,10 150,50 50,90" fill="white" fill-opacity="0.4"></polygon>
Line 121: Line 134:
 
         </header>
 
         </header>
 
         <!------------------------ WET LAB PAGE BANNER END ------------------------>
 
         <!------------------------ WET LAB PAGE BANNER END ------------------------>
−
 
−
        <!------------------------ WET LAB PAGE SIDE BAR + CONTENT START ------------------------>
 
−
        <div class="standard-page-side-bar-content-wrapper">
 
−
            <!------------------------ WET LAB PAGE SIDE BAR START ------------------------>
 
−
            <div class="standard-page-side-bar-wrapper">
 
−
                <ul class="standard-page-side-bar">
 
−
                    <li><a href="#overview">OVERVIEW</a></li>
 
−
                    <li><a href="#redoxprotein">REDOX-SENSITIVE FLUORESCENT PROTEINS</a></li>
 
−
                    <li><a href="#genetic">LIGHT-SENSITIVE GENETIC CIRCUITS</a></li>
 
−
                    <li><a href="#future">FUTURE WORK</a></li>
 
−
                </ul>
 
−
            </div>
 
−
            <!------------------------ WET LAB PAGE SIDE BAR END ------------------------>
 
  
 
             <!------------------------ WET LAB PAGE CONTENT START ------------------------>
 
             <!------------------------ WET LAB PAGE CONTENT START ------------------------>
−
             <div class="standard-page-content-wrapper">
+
             <div class="parts-page-content-wrapper">
−
<div class="standard-page-content-section-last">
+
<div class="parts-page-content-section-last">
 
<table class="tg" bordercolor = "#000000">
 
<table class="tg" bordercolor = "#000000">
 
  <tr>
 
  <tr>
Line 150: Line 150:
 
<td class="tg-0lax">RNA Thermometer</td>
 
<td class="tg-0lax">RNA Thermometer</td>
 
<td class="tg-0lax">Basic</td>
 
<td class="tg-0lax">Basic</td>
−
<td class="tg-0lax">An RNA thermometer active around 37°C</td>
+
<td class="tg-0lax">An RNA thermometer active around 37°C</td>
 
<td class="tg-0lax">Amith Punyala</td>
 
<td class="tg-0lax">Amith Punyala</td>
 
  </tr>
 
  </tr>
 
  <tr>
 
  <tr>
 
<td class="tg-0lax">BBa_K2561001</td>
 
<td class="tg-0lax">BBa_K2561001</td>
−
<td class="tg-0lax">𝛔F</td>
+
<td class="tg-0lax">σ<sup>F</sup></td>
 
<td class="tg-0lax">Basic</td>
 
<td class="tg-0lax">Basic</td>
−
<td class="tg-0lax">B. subtilis sigma factor for orthogonal expression in E. coli</td>
+
<td class="tg-0lax"><i>B. subtilis</i> sigma factor for orthogonal expression in <i>E. coli</i></td>
 
<td class="tg-0lax">Amith Punyala</td>
 
<td class="tg-0lax">Amith Punyala</td>
 
  </tr>
 
  </tr>
 
  <tr>
 
  <tr>
 
<td class="tg-0lax">BBa_K2561002</td>
 
<td class="tg-0lax">BBa_K2561002</td>
−
<td class="tg-0lax">PF2</td>
+
<td class="tg-0lax">P<sub>F2</sub></td>
 
<td class="tg-0lax">Basic</td>
 
<td class="tg-0lax">Basic</td>
−
<td class="tg-0lax">𝛔F Promoter</td>
+
<td class="tg-0lax">σ<sup>F</sup> promoter</td>
 +
<td class="tg-0lax">Amith Punyala</td>
 +
  </tr>
 +
                                          <tr>
 +
<td class="tg-0lax">BBa_K2561008</td>
 +
<td class="tg-0lax">hrpR</td>
 +
<td class="tg-0lax">Basic</td>
 +
<td class="tg-0lax">Enhancer binding protein as hrpRS dimer. Part of an AND logic gate</td>
 +
<td class="tg-0lax">Amith Punyala</td>
 +
  </tr>
 +
                                          <tr>
 +
<td class="tg-0lax">BBa_K2561009</td>
 +
<td class="tg-0lax">hrpS</td>
 +
<td class="tg-0lax">Basic</td>
 +
<td class="tg-0lax">Enhancer binding protein as hrpRS dimer. Part of an AND logic gate</td>
 +
<td class="tg-0lax">Amith Punyala</td>
 +
  </tr>
 +
                                          <tr>
 +
<td class="tg-0lax">BBa_K2561010</td>
 +
<td class="tg-0lax">hrpL promoter</td>
 +
<td class="tg-0lax">Basic</td>
 +
<td class="tg-0lax">𝛔<sup>54</sup>-recognized promoter whose activity is mediated by hrpRS EBP</td>
 
<td class="tg-0lax">Amith Punyala</td>
 
<td class="tg-0lax">Amith Punyala</td>
 
  </tr>
 
  </tr>
Line 199: Line 220:
 
<td class="tg-0lax">AND Reporter</td>
 
<td class="tg-0lax">AND Reporter</td>
 
<td class="tg-0lax">Composite</td>
 
<td class="tg-0lax">Composite</td>
−
<td class="tg-0lax">PhrpL promoter with sfGFP</td>
+
<td class="tg-0lax">P<sub>hrpL</sub> promoter with sfGFP</td>
 +
<td class="tg-0lax">Amith Punyala</td>
 +
  </tr>
 +
                                          <tr>
 +
<td class="tg-0lax">BBa_K2561011</td>
 +
<td class="tg-0lax">High Pass (AND) + Reporter</td>
 +
<td class="tg-0lax">Composite</td>
 +
<td class="tg-0lax">High pass filter with hrpR component of AND gate (BBa_K2561006)and reporter construct (BBa_K2561007)</td>
 
<td class="tg-0lax">Amith Punyala</td>
 
<td class="tg-0lax">Amith Punyala</td>
 
  </tr>
 
  </tr>
Line 206: Line 234:
 
             </div>
 
             </div>
 
             <!------------------------ WET LAB PAGE CONTENT END ------------------------>
 
             <!------------------------ WET LAB PAGE CONTENT END ------------------------>
−
        </div>
 
−
        <!------------------------ WET LAB PAGE SIDE BAR + CONTENT END ------------------------>
 
  
−
        <!------------------------ FOOTER START ------------------------>
+
 
 +
      <!------------------------ FOOTER START ------------------------>
 
         <footer>
 
         <footer>
 
             <div class="footer-wrapper">
 
             <div class="footer-wrapper">
 
                 <div class="icon-wrapper">
 
                 <div class="icon-wrapper">
−
                     <a class="icon" href=""><img src="images/facebook-32.png"></a>
+
                     <a class="icon" href=""><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/3/30/T--Cornell--Facebook.jpg"></a>
 
                 </div>
 
                 </div>
 
                 <div class="icon-wrapper">
 
                 <div class="icon-wrapper">
−
                     <a class="icon" href=""><img src="images/twitter-32.png"></a>
+
                     <a class="icon" href=""><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/0/02/T--Cornell--Twitter.jpg"></a>
 
                 </div>
 
                 </div>
 
                 <div class="icon-wrapper">
 
                 <div class="icon-wrapper">
−
                     <a class="icon" href=""><img src="images/instagram-32.png"></a>
+
                     <a class="icon" href=""><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/a/ae/T--Cornell--Instagram.jpg"></a>
 
                 </div>
 
                 </div>
 
                 <div class="icon-wrapper icon-wrapper-last">
 
                 <div class="icon-wrapper icon-wrapper-last">
−
                     <a class="icon" href=""><img src="images/youtube-32.png"></a>
+
                     <a class="icon" href=""><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/7/77/T--Cornell--Youtube.jpg"></a>
 
                 </div>
 
                 </div>
 
             </div>
 
             </div>

Latest revision as of 03:25, 18 October 2018

Team:Cornell - 2018.igem.org

Parts
BioBrick Number Name Type Description Designer
BBa_K2561000 RNA Thermometer Basic An RNA thermometer active around 37°C Amith Punyala
BBa_K2561001 σF Basic B. subtilis sigma factor for orthogonal expression in E. coli Amith Punyala
BBa_K2561002 PF2 Basic σF promoter Amith Punyala
BBa_K2561008 hrpR Basic Enhancer binding protein as hrpRS dimer. Part of an AND logic gate Amith Punyala
BBa_K2561009 hrpS Basic Enhancer binding protein as hrpRS dimer. Part of an AND logic gate Amith Punyala
BBa_K2561010 hrpL promoter Basic 𝛔54-recognized promoter whose activity is mediated by hrpRS EBP Amith Punyala
BBa_K2561003 Low Pass (GFP) Composite Low pass filter with sfGFP Amith Punyala
BBa_K2561004 Low Pass (AND) Composite Low pass filter with hrpS component of AND gate Amith Punyala
BBa_K2561005 High Pass (GFP) Composite High pass filter with sfGFP Amith Punyala
BBa_K2561006 High Pass (AND) Composite High pass filter with hrpR component of AND gate Amith Punyala
BBa_K2561007 AND Reporter Composite PhrpL promoter with sfGFP Amith Punyala
BBa_K2561011 High Pass (AND) + Reporter Composite High pass filter with hrpR component of AND gate (BBa_K2561006)and reporter construct (BBa_K2561007) Amith Punyala