Difference between revisions of "Team:NCKU Tainan/Notebook"

Line 13: Line 13:
 
         <div class="navbar-example">
 
         <div class="navbar-example">
 
             <div class="row">
 
             <div class="row">
−
                 <div class="col-10">
+
                 <div id="sidelist" class="list-Fgroup">
−
                    <div data-spy="scroll" data-target="#sidelist" data-offset="0" class="scrollspy-example">
+
                    <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#list-item-1">Accomplishment</a>
 +
                    <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#list-item-2">Introduction</a>
 +
                    <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#list-item-3">Device design</a>
 +
                    <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#list-item-4">Bioreactor</a>
 +
                    <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#list-item-5">Nutrient tank</a>
 +
                    <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#"><i class="fa fa-arrow-up fa-1x"
 +
                            aria-hidden="true"></i>
 +
                    </a>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="col-10">
 +
                <div data-spy="scroll" data-target="#sidelist" data-offset="0" class="scrollspy-example">
  
−
                        <h1 class="head2">Notebook</h1></br></br>
+
                    <h1 class="head2">Notebook</h1></br></br>
−
                        <h3>Construction of Pasr and Pgada</h3></br>
+
                    <h3>Construction of Pasr and Pgada</h3></br>
  
−
                        <p class="pcontent">4/26~4/27</br> </p>
+
                    <p class="pcontent">4/26~4/27</br> </p>
−
                        <ul>
+
                    <ul>
−
                            <li>PCR Pasr and Pgada from E. coli MG1655 chromosome. Confirmed and extracted
+
                        <li>PCR Pasr and Pgada from E. coli MG1655 chromosome. Confirmed and extracted
−
                                products by DNA gel. </li>
+
                            products by DNA gel. </li>
−
                        </ul></br>
+
                    </ul></br>
  
−
                        <p class="pcontent">4/28</br> </p>
+
                    <p class="pcontent">4/28</br> </p>
−
                        <ul>
+
                    <ul>
−
                            <li>Digested the pSB1C3-sfGFP plasmid. Ligase the plasmid with Pasr / Pgada and
+
                        <li>Digested the pSB1C3-sfGFP plasmid. Ligase the plasmid with Pasr / Pgada and
−
                                RiboJ by PCR. Confirmed by DNA gel electrophoresis. Transformed the gene in DH5
+
                            RiboJ by PCR. Confirmed by DNA gel electrophoresis. Transformed the gene in DH5
−
                                alpha and spread the bacteria on LB plates.</li>
+
                            alpha and spread the bacteria on LB plates.</li>
−
                        </ul></br>
+
                    </ul></br>
  
−
                        <p class="pcontent">4/30~5/1</br> </p>
+
                    <p class="pcontent">4/30~5/1</br> </p>
−
                        <ul>
+
                    <ul>
−
                            <li>Confirmed the transformation by colony PCR ,enzyme digestion and DNA gel
+
                        <li>Confirmed the transformation by colony PCR ,enzyme digestion and DNA gel
−
                                electrophoresis. Selected the correct colonies for sequencing and cultured them
+
                            electrophoresis. Selected the correct colonies for sequencing and cultured them
−
                                on LB plates.</li>
+
                            on LB plates.</li>
−
                        </ul></br>
+
                    </ul></br>
  
−
                        <p class="pcontent">5/9</br> </p>
+
                    <p class="pcontent">5/9</br> </p>
−
                        <ul>
+
                    <ul>
−
                            <li>Store the correct colonies in glycerol in -80O C.</li>
+
                        <li>Store the correct colonies in glycerol in -80O C.</li>
−
                        </ul></br>
+
                    </ul></br>
  
−
                        <p class="pcontent">6/1</br> </p>
+
                    <p class="pcontent">6/1</br> </p>
−
                        <ul>
+
                    <ul>
−
                            <li>Transformed each plasmid into BL21(DE3)</li>
+
                        <li>Transformed each plasmid into BL21(DE3)</li>
−
                        </ul></br>
+
                    </ul></br>
  
−
                        <h3>Construction of Pasr and Pgada</h3></br>
+
                    <h3>Construction of Pasr and Pgada</h3></br>
  
−
                        </br></br>
+
                    </br></br>
−
                        <p class="pcontent">5/9</br> </p>
+
                    <p class="pcontent">5/9</br> </p>
−
                        <ul>
+
                    <ul>
−
                            <li>Prepared the M9 medium in different pH value.</li>
+
                        <li>Prepared the M9 medium in different pH value.</li>
−
                        </ul></br>
+
                    </ul></br>
  
−
                        <p class="pcontent">5/11</br> </p>
+
                    <p class="pcontent">5/11</br> </p>
−
                        <ul>
+
                    <ul>
−
                            <li>Pre-cultured the DH5 alpha-pSB1C3 -Pasr-sfGFP strain.</li>
+
                        <li>Pre-cultured the DH5 alpha-pSB1C3 -Pasr-sfGFP strain.</li>
−
                        </ul></br>
+
                    </ul></br>
  
−
                        <p class="pcontent">5/12</br> </p>
+
                    <p class="pcontent">5/12</br> </p>
−
                        <ul>
+
                    <ul>
−
                            <li>Cultured the DH5 alpha-pSB1C3 -Pasr-sfGFP strain in M9 medium in different pH value.
+
                        <li>Cultured the DH5 alpha-pSB1C3 -Pasr-sfGFP strain in M9 medium in different pH value.
−
                                Measured the OD600 value and fluorescence every hour.</li>
+
                            Measured the OD600 value and fluorescence every hour.</li>
−
                        </ul></br>
+
                    </ul></br>
  
−
                        <p class="pcontent">5/18</br> </p>
+
                    <p class="pcontent">5/18</br> </p>
−
                        <ul>
+
                    <ul>
−
                            <li>Pre-cultured DH5 alpha-pSB1C3 –Pgada-RiboJ-sfGFP strain.</li>
+
                        <li>Pre-cultured DH5 alpha-pSB1C3 –Pgada-RiboJ-sfGFP strain.</li>
−
                            <li>Prepared the M9 medium in different pH value.</li>
+
                        <li>Prepared the M9 medium in different pH value.</li>
−
                        </ul></br>
+
                    </ul></br>
  
−
                        <p class="pcontent">5/19</br> </p>
+
                    <p class="pcontent">5/19</br> </p>
−
                        <ul>
+
                    <ul>
−
                            <li>Cultured the DH5 alpha-pSB1C3 –Pgada-RiboJ-sfGFP strain in M9 medium in different pH
+
                        <li>Cultured the DH5 alpha-pSB1C3 –Pgada-RiboJ-sfGFP strain in M9 medium in different pH
−
                                value. Measured the OD600 value and fluorescence every hour.</li>
+
                            value. Measured the OD600 value and fluorescence every hour.</li>
−
                        </ul></br>
+
                    </ul></br>
  
−
                        <p class="pcontent">6/2~6/3</br> </p>
+
                    <p class="pcontent">6/2~6/3</br> </p>
−
                        <ul>
+
                    <ul>
−
                            <li>Repeated the experiment on 5/11~5/12</li>
+
                        <li>Repeated the experiment on 5/11~5/12</li>
−
                        </ul></br>
+
                    </ul></br>
  
−
                        <p class="pcontent">7/29</br> </p>
+
                    <p class="pcontent">7/29</br> </p>
−
                        <ul>
+
                    <ul>
−
                            <li>Pre-culture the BL21(DE3)-pSB1C3 –Pasrr-sfGFP strain</li>
+
                        <li>Pre-culture the BL21(DE3)-pSB1C3 –Pasrr-sfGFP strain</li>
−
                        </ul></br>
+
                    </ul></br>
  
−
                        <p class="pcontent">7/30</br> </p>
+
                    <p class="pcontent">7/30</br> </p>
−
                        <ul>
+
                    <ul>
−
                            <li>Cultured the BL21(DE3)-pSB1C3 –Pasr -sfGFP strain on 96 well plate in different pH
+
                        <li>Cultured the BL21(DE3)-pSB1C3 –Pasr -sfGFP strain on 96 well plate in different pH
−
                                value. Measure the fluorescence every 5 minutes in 30 minutes.</li>
+
                            value. Measure the fluorescence every 5 minutes in 30 minutes.</li>
−
                        </ul></br>
+
                    </ul></br>
  
−
                        <p class="pcontent">9/4</br> </p>
+
                    <p class="pcontent">9/4</br> </p>
−
                        <ul>
+
                    <ul>
−
                            <li>Pre-culture the BL21(DE3)-pSB1C3 –Pgada-RiboJ-sfGFP strain</li>
+
                        <li>Pre-culture the BL21(DE3)-pSB1C3 –Pgada-RiboJ-sfGFP strain</li>
−
                        </ul></br>
+
                    </ul></br>
  
−
                        <p class="pcontent">9/5</br> </p>
+
                    <p class="pcontent">9/5</br> </p>
−
                        <ul>
+
                    <ul>
−
                            <li>Cultured the BL21(DE3)-pSB1C3 –Pgada-RiboJ-sfGFP strain strain on 96 well plate in
+
                        <li>Cultured the BL21(DE3)-pSB1C3 –Pgada-RiboJ-sfGFP strain strain on 96 well plate in
−
                                different pH value. Measure the fluorescence every 5 minutes in 30 minutes.</li>
+
                            different pH value. Measure the fluorescence every 5 minutes in 30 minutes.</li>
−
                        </ul></br>
+
                    </ul></br>
  
  
−
                    </div>
 
 
                 </div>
 
                 </div>
 
             </div>
 
             </div>
 
         </div>
 
         </div>
 +
    </div>
 
     </div>
 
     </div>
 
</body>
 
</body>

Revision as of 05:11, 22 September 2018

Notebook



Construction of Pasr and Pgada


4/26~4/27

  • PCR Pasr and Pgada from E. coli MG1655 chromosome. Confirmed and extracted products by DNA gel.

4/28

  • Digested the pSB1C3-sfGFP plasmid. Ligase the plasmid with Pasr / Pgada and RiboJ by PCR. Confirmed by DNA gel electrophoresis. Transformed the gene in DH5 alpha and spread the bacteria on LB plates.

4/30~5/1

  • Confirmed the transformation by colony PCR ,enzyme digestion and DNA gel electrophoresis. Selected the correct colonies for sequencing and cultured them on LB plates.

5/9

  • Store the correct colonies in glycerol in -80O C.

6/1

  • Transformed each plasmid into BL21(DE3)

Construction of Pasr and Pgada




5/9

  • Prepared the M9 medium in different pH value.

5/11

  • Pre-cultured the DH5 alpha-pSB1C3 -Pasr-sfGFP strain.

5/12

  • Cultured the DH5 alpha-pSB1C3 -Pasr-sfGFP strain in M9 medium in different pH value. Measured the OD600 value and fluorescence every hour.

5/18

  • Pre-cultured DH5 alpha-pSB1C3 –Pgada-RiboJ-sfGFP strain.
  • Prepared the M9 medium in different pH value.

5/19

  • Cultured the DH5 alpha-pSB1C3 –Pgada-RiboJ-sfGFP strain in M9 medium in different pH value. Measured the OD600 value and fluorescence every hour.

6/2~6/3

  • Repeated the experiment on 5/11~5/12

7/29

  • Pre-culture the BL21(DE3)-pSB1C3 –Pasrr-sfGFP strain

7/30

  • Cultured the BL21(DE3)-pSB1C3 –Pasr -sfGFP strain on 96 well plate in different pH value. Measure the fluorescence every 5 minutes in 30 minutes.

9/4

  • Pre-culture the BL21(DE3)-pSB1C3 –Pgada-RiboJ-sfGFP strain

9/5

  • Cultured the BL21(DE3)-pSB1C3 –Pgada-RiboJ-sfGFP strain strain on 96 well plate in different pH value. Measure the fluorescence every 5 minutes in 30 minutes.

Follow us
Contact us

igem.ncku.tainan@gmail.com
No.1, Daxue Rd., East Dist., Tainan City 701, Taiwan (R.O.C.)