Difference between revisions of "Team:NCKU Tainan/Parts"

(Prototype team page)
 
Line 1: Line 1:
−
{{NCKU_Tainan}}
+
{{NCKU_Tainan/header}} {{NCKU_Tainan/navbar}} {{NCKU_Tainan/style}}
 
<html>
 
<html>
−
 
+
    <head>
−
 
+
        <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Template:NCKU_Tainan/css/parts?action=raw&ctype=text/css">
−
<div class="column full_size">
+
    </head>
−
<h1>Parts</h1>
+
    <body data-spy="scroll" data-target=".navbar-example">
−
<p>Each team will make new parts during iGEM and will submit them to the Registry of Standard Biological Parts. The iGEM software provides an easy way to present the parts your team has created. The <code>&lt;groupparts&gt;</code> tag (see below) will generate a table with all of the parts that your team adds to your team sandbox.</p>
+
        <div class="container content">
−
<p>Remember that the goal of proper part documentation is to describe and define a part, so that it can be used without needing to refer to the primary literature. Registry users in future years should be able to read your documentation and be able to use the part successfully. Also, you should provide proper references to acknowledge previous authors and to provide for users who wish to know more.</p>
+
        <h1 class="head">Part</h1>
−
</div>
+
            <div class="navbar-example">
−
 
+
                <div class="row">
−
<div class="column full_size">
+
                    <div class="col-2 side">     
−
<div class="highlight decoration_background">
+
                        <div id="sidelist" class="list-group">
−
<h3>Note</h3>
+
                            <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#Basic_Parts">Basic Parts</a>
−
<p>Note that parts must be documented on the <a href="http://parts.igem.org/Main_Page"> Registry</a>. This page serves to <i>showcase</i> the parts you have made. Future teams and other users and are much more likely to find parts by looking in the Registry than by looking at your team wiki.</p>
+
                            <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#Composite_Parts">Composite Parts</a>
−
</div>
+
                            <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#"><i class="fa fa-arrow-up fa-1x" aria-hidden="true"></i></a>
−
</div>
+
                        </div>
−
 
+
                    </div>
−
<div class="clear extra_space"></div>
+
                    <div class="col-10">
−
<div class="line_divider"></div>
+
                        <div data-spy="scroll" data-target="#sidelist" data-offset="0" class="scrollspy-example">
−
<div class="clear extra_space"></div>
+
                            <div class="container">
−
 
+
                                <div id="Basic_Parts">
−
 
+
                                    <h3>Basic Parts</h3>
−
 
+
                                    <div class="card card-body">
−
 
+
                                        <table>
−
 
+
                                            <tr>
−
<div class="column two_thirds_size">
+
                                                <th colspan="1">Name</th>
−
<div class="highlight decoration_B_full">
+
                                                <th colspan="1">Description</th>
−
 
+
                                                <th colspan="1">Type</th>
−
<h3>Adding parts to the registry</h3>
+
                                                <th colspan="1">Length</th>                                                  
−
<p>You can add parts to the Registry at our <a href="http://parts.igem.org/Add_a_Part_to_the_Registry">Add a Part to the Registry</a> link.</p>
+
                                            </tr>
−
 
+
                                            <tr>
−
<p>We encourage teams to start completing documentation for their parts on the Registry as soon as you have it available. The sooner you put up your parts, the better you will remember all the details about your parts. Remember, you don't need to send us the DNA sample before you create an entry for a part on the Registry. (However, you <b>do</b> need to send us the DNA sample before the Jamboree. If you don't send us a DNA sample of a part, that part will not be eligible for awards and medal criteria.)</p>
+
                                                <td colspan="1">BBa_I719005</td>
−
<div class="button_link">
+
                                                <td colspan="1">T7 promoter</td>                                              
−
<a href="http://parts.igem.org/Add_a_Part_to_the_Registry">
+
                                                <td colspan="1">Promoter</td>
−
ADD PARTS
+
                                                <td colspan="1">23</td>
−
</a>
+
                                            </tr>
−
</div>
+
                                            <tr>
−
 
+
                                                <td colspan="1">BBa_R0010</td>
−
</div>
+
                                                <td colspan="1">LacI regulated promoter</td>                                              
−
</div>
+
                                                <td colspan="1">Promoter</td>
−
 
+
                                                <td colspan="1">200</td>
−
 
+
                                            </tr>
−
 
+
                                            <tr>
−
<div class="column third_size">
+
                                                <td colspan="1">BBa_K1231000</td>
−
<div class="highlight decoration_A_full">
+
                                                <td colspan="1">P<sub>asr</sub></td>                                               
−
<h3>Inspiration</h3>
+
                                                <td colspan="1">Promoter</td>
−
<p>We have a created  a <a href="http://parts.igem.org/Well_Documented_Parts">collection of well documented parts</a> that can help you get started.</p>
+
                                                <td colspan="1">140</td>
−
 
+
                                            </tr>
−
<p> You can also take a look at how other teams have documented their parts in their wiki:</p>
+
                                            <tr>
−
<ul>
+
                                                <td colspan="1">BBa_K1231000</td>
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:MIT/Parts"> 2014 MIT </a></li>
+
                                                <td colspan="1">P<sub>gadA</sub></td>                                               
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:Heidelberg/Parts"> 2014 Heidelberg</a></li>
+
                                                <td colspan="1">Promoter</td>
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:Tokyo_Tech/Parts">2014 Tokyo Tech</a></li>
+
                                                <td colspan="1">264</td>
−
</ul>
+
                                            </tr>
−
</div>
+
                                            <tr>
−
</div>
+
                                                <td colspan="1">BBa_B0034</td>
−
 
+
                                                <td colspan="1"></td>                                              
−
 
+
                                                <td colspan="1">RBS</td>
−
<div class="clear extra_space"></div>
+
                                                <td colspan="1">12</td>
−
 
+
                                            </tr>
−
 
+
                                            <tr>
−
 
+
                                                <td colspan="1">BBa_K1679038</td>
−
 
+
                                                <td colspan="1">RiboJ</td>                                               
−
<div class="column full_size">
+
                                                <td colspan="1">Insulator</td>
−
 
+
                                                <td colspan="1">75</td>
−
<h3>What information do I need to start putting my parts on the Registry?</h3>
+
                                            </tr>
−
<p>The information needed to initially create a part on the Registry is:</p>
+
                                            <tr>
−
<ul>
+
                                                <td colspan="1">BBa_B0015</td>
−
<li>Part Name</li>
+
                                                <td colspan="1">Double terminator consisting of BBa_B0010 and BBa_B0012</td>                                              
−
<li>Part type</li>
+
                                                <td colspan="1">Double terminator</td>
−
<li>Creator</li>
+
                                                <td colspan="1">129</td>
−
<li>Sequence</li>
+
                                            </tr>
−
<li>Short Description (60 characters on what the DNA does)</li>
+
                                            <tr>
−
<li>Long Description (Longer description of what the DNA does)</li>
+
                                                <td colspan="1">BBa_K2762000</td>
−
<li>Design considerations</li>
+
                                                <td colspan="1">Large subunit of the ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase (rbcL)</td>                                              
−
</ul>
+
                                                <td colspan="1">Coding</td>
−
 
+
                                                <td colspan="1">1416</td>
−
<p>
+
                                            </tr>
−
We encourage you to put up <em>much more</em> information as you gather it over the summer. If you have images, plots, characterization data and other information, please also put it up on the part page. </p>
+
                                            <tr>
−
 
+
                                                <td colspan="1">BBa_K2762001</td>
−
</div>
+
                                                <td colspan="1">Assembly chaperone of ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase (rbcX)</td>                                              
−
 
+
                                                <td colspan="1">Coding</td>
−
 
+
                                                <td colspan="1">1416</td>
−
<div class="clear extra_space"></div>
+
                                            </tr>
−
<div class="line_divider"></div>
+
                                            <tr>
−
<div class="clear extra_space"></div>
+
                                                <td colspan="1">BBa_K2762002</td>
−
 
+
                                                <td colspan="1">Small subunit of the ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase (rbcS)</td>                                               
−
<div class="column full_size">
+
                                                <td colspan="1">Coding</td>
−
<h3>Part Table </h3>
+
                                                <td colspan="1">336</td>
−
 
+
                                            </tr>
−
<p>Please include a table of all the parts your team has made during your project on this page. Remember part characterization and measurement data must go on your team part pages on the Registry. </p>
+
                                            <tr>
−
 
+
                                                <td colspan="1">BBa_K2762003</td>
−
</html>
+
                                                <td colspan="1">Phosphoribulokinase (prk)</td>                                               
−
<groupparts>iGEM18 NCKU_Tainan</groupparts>
+
                                                <td colspan="1">Coding</td>
−
<html>
+
                                                <td colspan="1">1002</td>
−
</div>
+
                                            </tr>
−
 
+
                                            <tr>
−
 
+
                                                <td colspan="1">BBa_K2762004</td>
−
 
+
                                                <td colspan="1">Carbonic anhydrases/dehydratases (icfA)</td>                                              
−
 
+
                                                <td colspan="1">Coding</td>
 +
                                                <td colspan="1">750</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                        </table>
 +
                                    </div>
 +
                                </div>
 +
                                <div id="Composite_Parts">
 +
                                    <h3>Composite Parts</h3>
 +
                                    <div class="card card-body">
 +
                                        <table>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <th colspan="1">Name</th>
 +
                                                <th colspan="1">Description</th>
 +
                                                <th colspan="1">Type</th>
 +
                                                <th colspan="1">Length</th>                                                   
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1">BBa_K2762005</td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>T7</sub>-B0034-rbcL-B0015</td>                                              
 +
                                                <td colspan="1" rowspan="12">Composite</td>
 +
                                                <td colspan="1">1633</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1">BBa_K2762006</td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>T7</sub>-B0034-rbcX-B0034-rbcS-B0015</td>
 +
                                                <td colspan="1">982</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1">BBa_K2762007</td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>lacI</sub>-B0034-prk-B0015</td>  
 +
                                                <td colspan="1">1403</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1">BBa_K2762008</td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>T7</sub>-B0034-icfA-B0015</td>
 +
                                                <td colspan="1">973</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1">BBa_K2762009</td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>lacI</sub>-B0034-rbcL-B0015</td>         
 +
                                                <td colspan="1">1810</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1">BBa_K2762010</td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>lacI</sub>-B0034-rbcX-B0034-rbcS-B0015</td>  
 +
                                                <td colspan="1">1159</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1">BBa_K2762011</td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>T7</sub>-B0034-rbcL-B0015-P<sub>T7</sub>-B0034-rbcX-B0034-rbcS-B0015</td>  
 +
                                                <td colspan="1">2757</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1">BBa_K2762012</td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>lacI</sub>-B0034-rbcL-B0015-P<sub>lacI</sub>-B0034-rbcX-B0034-rbcS-B0015</td> 
 +
                                                <td colspan="1">2934</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1">BBa_K2762013</td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>lacI</sub>-B0034-prk-B0015-P<sub>T7</sub>-B0034-icfA-B0015</td>  
 +
                                                <td colspan="1">2334</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1">BBa_K2762014</td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>asr</sub>-B0034-sfGFP-B0015</td>   
 +
                                                <td colspan="1">1014</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1">BBa_K2762015</td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>asr</sub>-B0034-sfGFP-B0015</td>   
 +
                                                <td colspan="1">1136</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1">BBa_K2762016</td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>gadA</sub>-riboJ-B0034-sfGFP-B0015</td>       
 +
                                                <td colspan="1">1213</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                        </table>
 +
                                    </div>  
 +
                                </div>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
        </div>
 +
        <script>
 +
        $(document).ready(function() {
 +
          $(window).scroll(function() {
 +
            var scrollPercentage = (document.documentElement.scrollTop + document.body.scrollTop) / (document.documentElement.scrollHeight - document.documentElement.clientHeight);     
 +
            if(scrollPercentage >= 0.97) {
 +
              var position = $("#sidelist").position();
 +
                if(position == undefined){}
 +
                else{
 +
                  $('#sidelist').css({"position": "fixed", "top": "105px"});
 +
                }
 +
            } else {
 +
              if ($(this).scrollTop() >= 90) {
 +
                var position = $("#sidelist").position();
 +
                if(position == undefined){}
 +
                else{
 +
                  $('#sidelist').css({"position": "fixed", "top": "145px", "margin-top": "0px"});
 +
                }
 +
              } else {
 +
                $('#sidelist').removeAttr('style');
 +
              }
 +
            } 
 +
          });
 +
          $(function(){
 +
            $('i.fa-arrow-up').click(function(){
 +
            $('html, body').animate({scrollTop:0},600);
 +
              return false;
 +
            });
 +
          });
 +
        });
 +
        </script>
 +
        <script src="https://2018.igem.org/Team:NCKU_Tainan/js/frame/T--NCKU_Tainan--jquery-1_12_4_min_js?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>
 +
        <script src="https://2018.igem.org/Template:NCKU_Tainan/js/bootstrap_min_js?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>
 +
    </body>
 
</html>
 
</html>
 +
{{NCKU_Tainan/footer}}

Revision as of 09:23, 27 September 2018

Part

Basic Parts

Name Description Type Length
BBa_I719005 T7 promoter Promoter 23
BBa_R0010 LacI regulated promoter Promoter 200
BBa_K1231000 Pasr Promoter 140
BBa_K1231000 PgadA Promoter 264
BBa_B0034 RBS 12
BBa_K1679038 RiboJ Insulator 75
BBa_B0015 Double terminator consisting of BBa_B0010 and BBa_B0012 Double terminator 129
BBa_K2762000 Large subunit of the ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase (rbcL) Coding 1416
BBa_K2762001 Assembly chaperone of ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase (rbcX) Coding 1416
BBa_K2762002 Small subunit of the ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase (rbcS) Coding 336
BBa_K2762003 Phosphoribulokinase (prk) Coding 1002
BBa_K2762004 Carbonic anhydrases/dehydratases (icfA) Coding 750

Composite Parts

Name Description Type Length
BBa_K2762005 PT7-B0034-rbcL-B0015 Composite 1633
BBa_K2762006 PT7-B0034-rbcX-B0034-rbcS-B0015 982
BBa_K2762007 PlacI-B0034-prk-B0015 1403
BBa_K2762008 PT7-B0034-icfA-B0015 973
BBa_K2762009 PlacI-B0034-rbcL-B0015 1810
BBa_K2762010 PlacI-B0034-rbcX-B0034-rbcS-B0015 1159
BBa_K2762011 PT7-B0034-rbcL-B0015-PT7-B0034-rbcX-B0034-rbcS-B0015 2757
BBa_K2762012 PlacI-B0034-rbcL-B0015-PlacI-B0034-rbcX-B0034-rbcS-B0015 2934
BBa_K2762013 PlacI-B0034-prk-B0015-PT7-B0034-icfA-B0015 2334
BBa_K2762014 Pasr-B0034-sfGFP-B0015 1014
BBa_K2762015 Pasr-B0034-sfGFP-B0015 1136
BBa_K2762016 PgadA-riboJ-B0034-sfGFP-B0015 1213
Follow us
Contact us

igem.ncku.tainan@gmail.com
No.1, Daxue Rd., East Dist., Tainan City 701, Taiwan (R.O.C.)