Difference between revisions of "Team:NCKU Tainan/Parts"

(Prototype team page)
 
 
(57 intermediate revisions by 5 users not shown)
Line 1: Line 1:
−
{{NCKU_Tainan}}
+
{{NCKU_Tainan/header}} {{NCKU_Tainan/navbar}} {{NCKU_Tainan/style}}
 
<html>
 
<html>
−
 
+
    <head>
−
 
+
        <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Template:NCKU_Tainan/css/parts?action=raw&ctype=text/css">
−
<div class="column full_size">
+
    </head>
−
<h1>Parts</h1>
+
    <body data-spy="scroll" data-target=".navbar-example">
−
<p>Each team will make new parts during iGEM and will submit them to the Registry of Standard Biological Parts. The iGEM software provides an easy way to present the parts your team has created. The <code>&lt;groupparts&gt;</code> tag (see below) will generate a table with all of the parts that your team adds to your team sandbox.</p>
+
        <div class="container content">
−
<p>Remember that the goal of proper part documentation is to describe and define a part, so that it can be used without needing to refer to the primary literature. Registry users in future years should be able to read your documentation and be able to use the part successfully. Also, you should provide proper references to acknowledge previous authors and to provide for users who wish to know more.</p>
+
            <div class="headstyle">
−
</div>
+
                <h1 class="head">Parts</h1>
−
 
+
            </div>
−
<div class="column full_size">
+
            <div class="righttitle">
−
<div class="highlight decoration_background">
+
                <h6 class="subtitle">The Building Blocks for a Cleaner Future</h6>
−
<h3>Note</h3>
+
            </div>
−
<p>Note that parts must be documented on the <a href="http://parts.igem.org/Main_Page"> Registry</a>. This page serves to <i>showcase</i> the parts you have made. Future teams and other users and are much more likely to find parts by looking in the Registry than by looking at your team wiki.</p>
+
            <div class="navbar-example">
−
</div>
+
                <div class="row">
−
</div>
+
                    <div class="col-2 side">     
−
 
+
                        <div id="sidelist" class="list-group">
−
<div class="clear extra_space"></div>
+
                            <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#Basic_Parts">Basic Parts</a>
−
<div class="line_divider"></div>
+
                            <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#Composite_Parts">Composite Parts</a>
−
<div class="clear extra_space"></div>
+
                            <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#"><i class="fa fa-arrow-up fa-1x" aria-hidden="true"></i></a>
−
 
+
                        </div>
−
 
+
                    </div>
−
 
+
                    <div class="col-10">
−
 
+
                        <div data-spy="scroll" data-target="#sidelist" data-offset="0" class="scrollspy-example">
−
 
+
                            <div class="container">
−
<div class="column two_thirds_size">
+
                                <div id="Basic_Parts">
−
<div class="highlight decoration_B_full">
+
                                    <h3>Basic Parts</h3>
−
 
+
                                    <div class="card card-body">
−
<h3>Adding parts to the registry</h3>
+
                                        <table>
−
<p>You can add parts to the Registry at our <a href="http://parts.igem.org/Add_a_Part_to_the_Registry">Add a Part to the Registry</a> link.</p>
+
                                            <tr>
−
 
+
                                                <th colspan="1">Name</th>
−
<p>We encourage teams to start completing documentation for their parts on the Registry as soon as you have it available. The sooner you put up your parts, the better you will remember all the details about your parts. Remember, you don't need to send us the DNA sample before you create an entry for a part on the Registry. (However, you <b>do</b> need to send us the DNA sample before the Jamboree. If you don't send us a DNA sample of a part, that part will not be eligible for awards and medal criteria.)</p>
+
                                                <th colspan="1">Description</th>
−
<div class="button_link">
+
                                                <th colspan="1">Type</th>
−
<a href="http://parts.igem.org/Add_a_Part_to_the_Registry">
+
                                                <th colspan="1">Length</th>                                                   
−
ADD PARTS
+
                                            </tr>
−
</a>
+
                                            <tr>
−
</div>
+
                                                <td colspan="1"><a class="link" href="http://parts.igem.org/Part:BBa_I719005" target="_blank">BBa_R0005</a></td>
−
 
+
                                                <td colspan="1">T7 promoter</td>                                              
−
</div>
+
                                                <td colspan="1">Promoter</td>
−
</div>
+
                                                <td colspan="1">23</td>
−
 
+
                                            </tr>
−
 
+
                                            <tr>
−
 
+
                                                <td colspan="1"><a class="link" href="http://parts.igem.org/Part:BBa_R0010" target="_blank">BBa_R0010</a></td>
−
<div class="column third_size">
+
                                                <td colspan="1">LacI regulated promoter</td>                                              
−
<div class="highlight decoration_A_full">
+
                                                <td colspan="1">Promoter</td>
−
<h3>Inspiration</h3>
+
                                                <td colspan="1">200</td>
−
<p>We have a created  a <a href="http://parts.igem.org/Well_Documented_Parts">collection of well documented parts</a> that can help you get started.</p>
+
                                            </tr>
−
 
+
                                            <tr>
−
<p> You can also take a look at how other teams have documented their parts in their wiki:</p>
+
                                                <td colspan="1"><a class="link" href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K1231000" target="_blank">BBa_K1231000</a></td>
−
<ul>
+
                                                <td colspan="1">P<sub>asr</sub></td>                                               
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:MIT/Parts"> 2014 MIT </a></li>
+
                                                <td colspan="1">Promoter</td>
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:Heidelberg/Parts"> 2014 Heidelberg</a></li>
+
                                                <td colspan="1">140</td>
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:Tokyo_Tech/Parts">2014 Tokyo Tech</a></li>
+
                                            </tr>
−
</ul>
+
                                            <tr>
−
</div>
+
                                                <td colspan="1"><a class="link" href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K1231001" target="_blank">BBa_K1231001</a></td>
−
</div>
+
                                                <td colspan="1">P<sub>gadA</sub></td>                                               
−
 
+
                                                <td colspan="1">Promoter</td>
−
 
+
                                                <td colspan="1">264</td>
−
<div class="clear extra_space"></div>
+
                                            </tr>
−
 
+
                                            <tr>
−
 
+
                                                <td colspan="1"><a class="link" href="http://parts.igem.org/Part:BBa_B0034"target="_blank">BBa_K1231034</a></td>
−
 
+
                                                <td colspan="1">RBS</td>                                               
−
 
+
                                                <td colspan="1">RBS</td>
−
<div class="column full_size">
+
                                                <td colspan="1">12</td>
−
 
+
                                            </tr>
−
<h3>What information do I need to start putting my parts on the Registry?</h3>
+
                                            <tr>
−
<p>The information needed to initially create a part on the Registry is:</p>
+
                                                <td colspan="1"><a class="link" href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K1679038" target="_blank">BBa_K1231038</a></td>
−
<ul>
+
                                                <td colspan="1">RiboJ</td>                                               
−
<li>Part Name</li>
+
                                                <td colspan="1">Insulator</td>
−
<li>Part type</li>
+
                                                <td colspan="1">75</td>
−
<li>Creator</li>
+
                                            </tr>
−
<li>Sequence</li>
+
                                            <tr>
−
<li>Short Description (60 characters on what the DNA does)</li>
+
                                                <td colspan="1"><a class="link" href="http://parts.igem.org/Part:BBa_B0015" target="_blank">BBa_K1231015</a></td>
−
<li>Long Description (Longer description of what the DNA does)</li>
+
                                                <td colspan="1">Double terminator consisting of BBa_R0010 and BBa_B0012</td>                                               
−
<li>Design considerations</li>
+
                                                <td colspan="1">Double terminator</td>
−
</ul>
+
                                                <td colspan="1">129</td>
−
 
+
                                            </tr>
−
<p>
+
                                            <tr>
−
We encourage you to put up <em>much more</em> information as you gather it over the summer. If you have images, plots, characterization data and other information, please also put it up on the part page. </p>
+
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762000" target="_blank">BBa_K2762000</a></td>
−
 
+
                                                <td colspan="1">Large subunit of the ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (<i>rbcL</i>)</td>                                               
−
</div>
+
                                                <td colspan="1">Coding</td>
−
 
+
                                                <td colspan="1">1416</td>
−
 
+
                                            </tr>
−
<div class="clear extra_space"></div>
+
                                            <tr>
−
<div class="line_divider"></div>
+
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762001" target="_blank">BBa_K2762001</a></td>
−
<div class="clear extra_space"></div>
+
                                                <td colspan="1">Assembly chaperone of ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (<i>rbcX</i>)</td>                                               
−
 
+
                                                <td colspan="1">Coding</td>
−
<div class="column full_size">
+
                                                <td colspan="1">405</td>
−
<h3>Part Table </h3>
+
                                            </tr>
−
 
+
                                            <tr>
−
<p>Please include a table of all the parts your team has made during your project on this page. Remember part characterization and measurement data must go on your team part pages on the Registry. </p>
+
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762002" target="_blank">BBa_K2762002</a></td>
−
 
+
                                                <td colspan="1">Small subunit of the ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (<i>rbcS</i>)</td>                                               
−
</html>
+
                                                <td colspan="1">Coding</td>
−
<groupparts>iGEM18 NCKU_Tainan</groupparts>
+
                                                <td colspan="1">336</td>
−
<html>
+
                                            </tr>
−
</div>
+
                                            <tr>
−
 
+
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762003" target="_blank">BBa_K2762003</a></td>
−
 
+
                                                <td colspan="1">Phosphoribulokinase (<i>prk</i>)</td>                                               
−
 
+
                                                <td colspan="1">Coding</td>
−
 
+
                                                <td colspan="1">1002</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762004" target="_blank">BBa_K2762004</a></td>
 +
                                                <td colspan="1">Carbonic anhydrases/dehydratases (<i>ccaA</i>)</td>                                              
 +
                                                <td colspan="1">Coding</td>
 +
                                                <td colspan="1">750</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762017" target="_blank">BBa_K2762017</a></td>
 +
                                                <td colspan="1">Superfolder green fluorescence protein (<i>sfgfp</i>)</td>                                               
 +
                                                <td colspan="1">Coding</td>
 +
                                                <td colspan="1">720</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                        </table>
 +
                                    </div>  
 +
                                </div>
 +
                                <div id="Composite_Parts">
 +
                                    <h3>Composite Parts</h3>
 +
                                    <div class="card card-body">
 +
                                        <table>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <th colspan="1">Name</th>
 +
                                                <th colspan="1">Description</th>
 +
                                                <th colspan="1">Type</th>
 +
                                                <th colspan="1">Length</th>                                                   
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762005" target="_blank">BBa_K2762005</a></td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>T7</sub>-B0034-<i>rbcL</i>-B0015</td>                                               
 +
                                                <td colspan="1" rowspan="12">Composite</td>
 +
                                                <td colspan="1">1602</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762006" target="_blank">BBa_K2762006</a></td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>T7</sub>-B0034-<i>rbcX</i>-B0034-<i>rbcS</i>-B0015</td>  
 +
                                                <td colspan="1">953</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762007" target="_blank">BBa_K2762007</a></td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>LacI</sub>-B0034-<i>prk</i>-B0015</td>
 +
                                                <td colspan="1">1365</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762008" target="_blank">BBa_K2762008</td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>T7</sub>-B0034-<i>ccaA</i>-B0015</td>  
 +
                                                <td colspan="1">936</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762009" target="_blank">BBa_K2762009</a></td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>LacI</sub>-B0034-<i>rbcL</i>-B0015</td>         
 +
                                                <td colspan="1">1779</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762010" target="_blank">BBa_K2762010</a></td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>LacI</sub>-B0034-<i>rbcX</i>-B0034-<i>rbcS</i>-B0015</td>
 +
                                                <td colspan="1">1130</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762011" target="_blank">BBa_K2762011</a></td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>T7</sub>-B0034-<i>rbcL</i>-B0015-P<sub>T7</sub>-B0034-<i>rbcX</i>-B0034-<i>rbcS</i>-B0015</td>
 +
                                                <td colspan="1">2563</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762012" target="_blank">BBa_K2762012</a></td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>LacI</sub>-B0034-<i>rbcL</i>-B0015-P<sub>LacI</sub>-B0034-<i>rbcX</i>-B0034-<i>rbcS</i>-B0015</td> 
 +
                                                <td colspan="1">2917</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762013" target="_blank">BBa_K2762013</a></td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>LacI</sub>-B0034-<i>prk</i>-B0015-P<sub>T7</sub>-B0034-<i>ccaA</i>-B0015</td>  
 +
                                                <td colspan="1">2309</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762014" target="_blank">BBa_K2762014</a></td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>asr</sub>-B0034-<i>sfgfp</i></td>   
 +
                                                <td colspan="1">886</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762014" target="_blank">BBa_K2762015</a></td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>gadA</sub>-B0030-<i>gfp</i></td>  
 +
                                                <td colspan="1">1150</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                            <tr>
 +
                                                <td colspan="1"><a class=link href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2762016" target="_blank">BBa_K2762016</a></td>
 +
                                                <td colspan="1">P<sub>gadA</sub>-RiboJ-B0030-<i>gfp</i></td>       
 +
                                                <td colspan="1">1233</td>
 +
                                            </tr>
 +
                                           
 +
                                        </table>
 +
                                    </div>  
 +
                                </div>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
        </div>
 +
        <script>
 +
        $(document).ready(function() {
 +
          $(window).scroll(function() {
 +
            var scrollPercentage = (document.documentElement.scrollTop + document.body.scrollTop) / (document.documentElement.scrollHeight - document.documentElement.clientHeight);     
 +
            if(scrollPercentage >= 0.97) {
 +
              var position = $("#sidelist").position();
 +
                if(position == undefined){}
 +
                else{
 +
                  $('#sidelist').css({"position": "fixed", "top": "105px"});
 +
                }
 +
            } else {
 +
              if ($(this).scrollTop() >= 500) {
 +
                var position = $("#sidelist").position();
 +
                if(position == undefined){}
 +
                else{
 +
                  $('#sidelist').css({"position": "fixed", "top": "145px", "margin-top": "0px"});
 +
                }
 +
              } else {
 +
                $('#sidelist').removeAttr('style');
 +
              }
 +
            } 
 +
          });
 +
          $(function(){
 +
            $('i.fa-arrow-up').click(function(){
 +
            $('html, body').animate({scrollTop:0},600);
 +
              return false;
 +
            });
 +
          });
 +
        });
 +
        </script>
 +
        <script src="https://2018.igem.org/Team:NCKU_Tainan/js/frame/T--NCKU_Tainan--jquery-1_12_4_min_js?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>
 +
        <script src="https://2018.igem.org/Template:NCKU_Tainan/js/bootstrap_min_js?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>
 +
    </body>
 
</html>
 
</html>
 +
{{NCKU_Tainan/footer}}

Latest revision as of 00:18, 18 October 2018

Parts

The Building Blocks for a Cleaner Future

Basic Parts

Name Description Type Length
BBa_R0005 T7 promoter Promoter 23
BBa_R0010 LacI regulated promoter Promoter 200
BBa_K1231000 Pasr Promoter 140
BBa_K1231001 PgadA Promoter 264
BBa_K1231034 RBS RBS 12
BBa_K1231038 RiboJ Insulator 75
BBa_K1231015 Double terminator consisting of BBa_R0010 and BBa_B0012 Double terminator 129
BBa_K2762000 Large subunit of the ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (rbcL) Coding 1416
BBa_K2762001 Assembly chaperone of ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (rbcX) Coding 405
BBa_K2762002 Small subunit of the ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (rbcS) Coding 336
BBa_K2762003 Phosphoribulokinase (prk) Coding 1002
BBa_K2762004 Carbonic anhydrases/dehydratases (ccaA) Coding 750
BBa_K2762017 Superfolder green fluorescence protein (sfgfp) Coding 720

Composite Parts

Name Description Type Length
BBa_K2762005 PT7-B0034-rbcL-B0015 Composite 1602
BBa_K2762006 PT7-B0034-rbcX-B0034-rbcS-B0015 953
BBa_K2762007 PLacI-B0034-prk-B0015 1365
BBa_K2762008 PT7-B0034-ccaA-B0015 936
BBa_K2762009 PLacI-B0034-rbcL-B0015 1779
BBa_K2762010 PLacI-B0034-rbcX-B0034-rbcS-B0015 1130
BBa_K2762011 PT7-B0034-rbcL-B0015-PT7-B0034-rbcX-B0034-rbcS-B0015 2563
BBa_K2762012 PLacI-B0034-rbcL-B0015-PLacI-B0034-rbcX-B0034-rbcS-B0015 2917
BBa_K2762013 PLacI-B0034-prk-B0015-PT7-B0034-ccaA-B0015 2309
BBa_K2762014 Pasr-B0034-sfgfp 886
BBa_K2762015 PgadA-B0030-gfp 1150
BBa_K2762016 PgadA-RiboJ-B0030-gfp 1233
Follow us
Contact us

igem.ncku.tainan@gmail.com
No.1, Daxue Rd., East Dist., Tainan City 701, Taiwan (R.O.C.)