Difference between revisions of "Team:UC Davis/SupplementalMaterials"

(Created page with "{{UC_Davis}} {{Template: UC_Davis/header}} <html> <head> <style> body { background-color: #fff ; font-family: BernardMT Condensed ; color: black;...")
 
 
(15 intermediate revisions by 2 users not shown)
Line 1: Line 1:
−
{{UC_Davis}} {{Template: UC_Davis/header}}
+
{{Template: UC_Davis/header}}
−
<html>
+
<html lang="en">
  
 
<head>
 
<head>
 +
  <title>Supplementary</title>
 +
  <link rel="stylesheet" href="https://cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/font-awesome/4.7.0/css/font-awesome.min.css">
 +
  </head>
 +
  <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1">
 
   <style>
 
   <style>
−
    body {
+
    body {
 
       background-color: #fff ;
 
       background-color: #fff ;
−
       font-family: BernardMT Condensed ;
+
       font-family: 'PT Sans', sans-serif;
 
       color: black;
 
       color: black;
−
       font-size:16px;
+
       font-size:13px;
 +
line-height: 200%;
 
       min-width: 600px;
 
       min-width: 600px;
−
       max-width: 1000px;
+
       margin-top:-7px;
−
       margin-left: 100px;
+
       margin-bottom:-17px;
−
 
+
     
 
     }
 
     }
 +
/*------------Get rid of iGEM stuff----------------------------------*/
 +
#home_logo, #sideMenu { display:none; }
 +
#sideMenu, #top_title11, .patrollink  {display:none;}
 +
#content { margin-left:0px; margin-top:-7px; padding:0px; width:100%;}
 +
/*-------------------------------------------------------------------*/
 
   </style>
 
   </style>
−
</head>
 
  
 
<body>
 
<body>
−
  <div style='padding-top: 150px;'></div>
+
<div style='padding-top: 30px;'></div>
 
   <center>
 
   <center>
−
   <div style = ' padding-bottom: 30px; font-size: 40px; color: #d9a900'; ><b>Supplementary Material</b></div>
+
   <div style = 'padding-bottom: 60px; font-size: 30px; color: #d9a900'; ><b>Supplementary Material</b></div>
−
  </center>
+
</center>
−
  <div style='padding-top: 30px;'></div>
+
−
  <div style = 'padding-bottom: 22px; font-size: 25px; color: #d9a900'; ><b>I. Full FASTA Sequences</b></div>
+
−
 
+
−
  <div style='padding-top: 20px;'></div>
+
−
        <div style = 'font-size: 20px;color: #a6d4f4; padding-right: 130PX; line-height: 25px; padding-bottom: 20px;' ><b><i>
+
−
          i. Metallothionein 1 promoter
+
−
 
+
−
        </b></i>
+
−
        </div>
+
−
 
+
−
 
+
−
      <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; padding-bottom: 10px; line-height: 25px;' >
+
−
        <b>MT1_promoter_mus_musculus</b>
+
−
      </div>
+
−
 
+
−
      <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; line-height: 25px;' >
+
−
        CCACACGTCACATGGGTCGTCCTATCCGAGCCAGTCGTGCCAAAGGGGCGGTCCCGCTGT
+
−
        GCACACTGGCGCTCCAGGGAGCTCTGCACTCCGCCCGAAAAGTGCGCTCGGCTCTGCCA
+
−
        AGGACGCGGGGCGCGTGACTATGCGTGGGCTGGAGCAACCGCCTGCTGGGTGCAAACCC
+
−
        TTTGCGCCCGGACTCGTCCAACGACTATAAAGAGGGCAGGCTGTCCTCTAAGCGTCACCA
+
−
        CGACTTCAACGTCCTGAGTACCTTCTCCTCACTTACTCCGTAGCTCCAGCTTCACCAGATCT
+
−
        CGGAA
+
−
 
+
−
      </div>
+
−
 
+
−
 
+
−
      <div style='padding-top: 20px;'></div>
+
−
            <div style = 'font-size: 20px;color: #a6d4f4; padding-right: 130PX; line-height: 25px; padding-bottom: 20px;' ><b><i>
+
−
              ii. Metallothionein 2a full promoter
+
−
            </b></i>
+
−
            </div>
+
−
          <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; padding-bottom: 10px; line-height: 25px;' >
+
−
            <b>X00504.1 Human metallothionein gene IIA promoter region</b>
+
−
          </div>
+
−
 
+
−
          <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; line-height: 25px;' >
+
−
            ACACGGCGGAGGCGCACGGCGTGGGCACCCAGCACCCGGTACACTGTGTCCTCCCGCTG
+
−
            CACCCAGCCCCTTCAGCGCGAGGCGTCCCCGAGGCGCAAGTGGGCCGCCTTCAGGGAAC
+
−
            TGACCGCCCGCGGCCCGTGTGCAGAGCCGGGTGCGCCCGGCCCAGTGCGCGCGGCCGG
+
−
            GTGTTTCGCTTGGAGCCGCAAGTGACTTCTAGCGCGGGGCGTGTGCAGGGACGGCCGGG
+
−
            GCGGGGCTTTTGCACTCGTCCCGGCTCTTTCTAGCTATAAACACTGCTTGCCGCGCTGCAC
+
−
            TCCACCACGCCTCCTCCAAGTCCCAGCGAACCCGCGTGCAACCTGTCCCGACTCTAGCCG
+
−
            CCTCTTCAGCTCGCCATGATC
+
−
 
+
−
          </div>
+
−
 
+
−
 
+
−
 
+
−
 
+
−
          <div style='padding-top: 20px;'></div>
+
−
                <div style = 'font-size: 20px;color: #a6d4f4; padding-right: 130PX; line-height: 25px; padding-bottom: 20px;' ><b><i>
+
−
                  iii. Metallothionein 2a minimal promoter version 1
+
−
                </b></i>
+
−
                </div>
+
−
              <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; padding-bottom: 10px; line-height: 25px;' >
+
−
                <b>MT2_promoter_59_bp_homo_sapiens </b>
+
−
              </div>
+
−
 
+
−
              <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; line-height: 25px;' >
+
−
                CGTCCCGGCTCTTTCTAGCTATAAACACTGCTTGCCGCGCTGCACTCCACCACGCCTCC
+
−
              </div>
+
−
 
+
−
 
+
−
              <div style='padding-top: 20px;'></div>
+
−
                    <div style = 'font-size: 20px;color: #a6d4f4; padding-right: 130PX; line-height: 25px; padding-bottom: 20px;' ><b><i>
+
−
                      iv. Metallothionein 2a minimal promoter version 2
+
−
                    </b></i>
+
−
                    </div>
+
−
                  <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; padding-bottom: 10px; line-height: 25px;' >
+
−
                    <b>MT2a_promoter_60_bp_first_A_added_homo_sapiens  </b>
+
−
                  </div>
+
−
 
+
−
                  <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; line-height: 25px;' >
+
−
                    ACGTCCCGGCTCTTTCTAGCTATAAACACTGCTTGCCGCGCTGCACTCCACCACGCCTCC
+
−
                  </div>
+
−
 
+
−
 
+
−
                  <div style='padding-top: 20px;'></div>
+
−
                        <div style = 'font-size: 20px;color: #a6d4f4; padding-right: 130PX; line-height: 25px; padding-bottom: 20px;' ><b><i>
+
−
                          v. Metallothionein 2a minimal promoter version 3
+
−
                        </b></i>
+
−
                        </div>
+
−
                      <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; padding-bottom: 10px; line-height: 25px;' >
+
−
                        <b>MT2a_promoter_60_bp_last_A_added_homo_sapiens  </b>
+
−
                      </div>
+
−
 
+
−
                      <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; line-height: 25px;' >
+
−
                        CGTCCCGGCTCTTTCTAGCTATAAACACTGCTTGCCGCGCTGCACTCCACCACGCCTCCA
+
−
                      </div>
+
−
 
+
−
 
+
−
                      <div style='padding-top: 20px;'></div>
+
−
                            <div style = 'font-size: 20px;color: #a6d4f4; padding-right: 130PX; line-height: 25px; padding-bottom: 20px;' ><b><i>
+
−
                              vi. CYP1A1 promoter
+
−
                            </b></i>
+
−
                            </div>
+
−
                          <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; padding-bottom: 10px; line-height: 25px;' >
+
−
                            <b>NG_055251.1:101-1802 Mus musculus Cyp1a1 5' regulatory region (LOC110467519) on chromosome 9  </b>
+
−
                          </div>
+
−
 
+
−
                          <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; line-height: 25px;' >
+
−
                          ACTGTCCCCTGCATATCATTTATCTTTCTAGTGCTCTTTTTGTACTATGCCTGTCTCTGTGTT
+
−
                          TTGTTACTTATCACCTGTTTCCCCCATAGCAGCGGGTAAGCTTCGTCAAAGGAGTATTGTTA
+
−
                          ATCCTTTTCACCTCTGCATCAATCACCAGCATCCAGCATAGTAGGAGCTTGGCGAATATTTG
+
−
                          CACAATGCATGAGGGCGGCATGTAACTAGAGTGGGAGGTGAGGGGGTGGATGAAGTGTT
+
−
                          GTTTTTTTTTCCTGGTCTTGGTCACAGAGCAGATATCAATGTTCTTTCTGGGCTCGGGAGCT
+
−
                          CACAGGGGAGGGCAGGTGAAGGTGTTAGTTAGGAACAGGTTGAGTTAGACACGCCAAGTT
+
−
                          CAGATGTTCTTCTTACACTAATCTCACTCTGGGAGCACCCTTCAGGGCCAGAGAGCACCTG
+
−
                          CAAAACAGCCAGCTAGGCGTGCCGGGTGGTGCTGCGTGTCCTGCCACTAAAAATGTGGAC
+
−
                          ACACGCTGTTCAGGCCTTTGCTCTCAGGCAGAAGCCGAGCATCGCACGCAAACCCGGCCC
+
−
                          TTTGCACCGCTGGCGCTGTCTTGTCGCGCCCTTGCAAAGCATAGACTATTTCTATCTCTTAA
+
−
                          ACCCCACCCCAACGCCCCAGGAGAGCTGGCCCTTTAAGAGCCTCACCCACGGTTCCCCTC
+
−
                          CCCCAGCTAGCGTGACAGCACTGGGACCCGCGCCCGGTTGTGAGTTGGGTAGCTGGGTG
+
−
                          GCTGCGCGGGCCTCCAGGCTCTTCTCACGCAACTCCGGGGCACCTTGTCCCCAGCCAGG
+
−
                          TGGGGCGGAGACAGGCAGCCCGACCTCTGCCCCCAGAGGATGGAGCAGGCTTACGCACG
+
−
                          CTAGCCTCAGGAACCTGTGTGCGTGCCAAGCATCACCCTTTGTAGCCCCAGACCCCCTCC
+
−
                          TGCTGTCTCGCGTGGATCCTTCCTCCACCCTTTCCTCCACCATACTTAGATAGCTCTGCAC
+
−
                          CCGCCGCCCGACTTCTCTGTGTTGCCTGCTTCAGTATGTATGCACAACACTAGCAAGCCCC
+
−
                          GGGAGCCTACAGGGAGCTGCAAGCGGGGACTCCCGGGCTTGCAGCTTGCCTAAGGTGAC
+
−
                          CCTTAGAGGTGAGATCTGCAAGCCTGCCATCCATCCCCACCCTCTAGATGAAGCAGCGCG
+
−
                          AACTTCGGCCGATACCCAATTTGTGGGGCACAGAGTCAGTCCAATGGCGCCACTGGCCTT
+
−
                          CCTGTCCTGTGACCTCTGGGCTGGGGTCGTTGCGCTTCTCACGCGAGCTTGGACTCAGTA
+
−
                          ATCCAGGGAAGCAAAGTCACCACCCAGCTGTTCTCCCTCTACCAGCCTTTCCCGGGCACC
+
−
                          CATTGGCTTGTAGTAGGCAAGAGGATCTTACACACTGAATGTTTCAGGGGTGCAAAAATAG
+
−
                          TGAAAAGGAATCCCTATGACCCGGAATGGAGGCCCCAGTACTTACTTTTTAGGTTACCCCA
+
−
                          GAATTTTTCCTCAAACCCCTCCCTCAGTGGGATTATGCACTGTCCATGGAGCACCTTGAAA
+
−
                          GTGTGGGGGGTGGTGACCCCAACCTTTATTCTTTTTCTTTTCTTATGTTTTTTTGTGCCTGTA
+
−
                          CCTACATCAGGTATCCGGTATGGCTTCTTGCCTATCTCCCCCCTCCCCCCTGCCTAGAGCA
+
−
                          CTCCCTAAGGCTGTCCCTCCCTCGGTCCCACCACTGGGCTCAGATAAGGAGGCGTGGCCA
+
−
                          ACAGACACAGAGTCCTATAAAGGTGGTGGTGCCTTCACCCTAACCCTGAAGGTGGTAGTTC
+
−
                          TTGGAGCTTCCCCGATCCTCCCTAGGGTCCTAGAGAACACTCTTCACTTCAGTCCCTCCTT
+
−
                          ACAGCCCAAGGTGAGTGCTTGGGGGGGCTCCTGGATTGCCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTC
+
−
                          CCTCCCTCCCTCCCAAGAAAAGGA
+
−
                          </div>
+
−
 
+
−
                <div style='padding-top: 20px;'></div>
+
−
                      <div style = 'font-size: 20px;color: #a6d4f4; padding-right: 130PX; line-height: 25px; padding-bottom: 20px;' ><b><i>
+
−
                          Vii. FGF21 promoter
+
−
                        </b></i>
+
−
                      </div>
+
−
                      <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; padding-bottom: 10px; line-height: 25px;' >
+
−
                        <b>FGF21_promoter_homo_sapiens </b>
+
−
                      </div>
+
−
 
+
−
                      <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; line-height: 25px;' >
+
−
GCCACCCCTCCCCCCAGGTTATTTCAGGAGCACCTGCCTGGGCCTGGGATGGCTTCTCTG
+
−
GTGAAAGAAACACCAGGATTGCATCAGGGAGGAGGAGGCTGGGATGTCCAGGGTCTGAG
+
−
CATCTGAGCAGGGACAGATGAGGTTGAGGTTGGCCCACGGCCAGGTGAGAGGCTTCCAA
+
−
GGCAGGATACTTGTGTCTCAGATGCGGTCGCTTCTTTCATACAGCAATTGCCGCCTTGCTG
+
−
AGGATCAAGGAACCTCAGTGTCAGATCACGCCCTCCCCCCAAACTTAGAAATTCAGATGGG
+
−
GCGCAGAAATTTCTCTTGTTCTGCGTGATCTGCATAGATGGTCCAAGAGGTGGTTTTTCCA
+
−
GGAGCCCAGCACCCCTCCTCCCTCCGACTCAGGTGCTTGAGACCCCAGATCCTTCTCTCT
+
−
GAGACTCAGGAATGTGGGCCCCCAGCCCCTTTCACCTGGGTCCCAGCTAACCCGATCCTC
+
−
CCCTCCCTCATCCCCTAGACCCAGGAGTCTGGCCCTCCATTGAAAGGACCCCAGGTTACA
+
−
TCATCCATTCAGGCTGCCCTTGCCACGATGGAATTCTGTAGCTCCTGCCAAATGGGTCAAA
+
−
TATCATGGTTCAGGCGCAGGGAGGGTGATTGGGCGGGCCTGTCTGGGTATAAATTCTGGA
+
−
GCTTCTGCATCTATCCCAAAAAACAAGGGTGTT
+
−
                      </div>
+
−
 
+
−
 
+
−
                      <div style='padding-top: 20px;'></div>
+
−
                            <div style = 'font-size: 20px;color: #a6d4f4; padding-right: 130PX; line-height: 25px; padding-bottom: 20px;' ><b><i>
+
−
                              viii. GADD45α promoter
+
−
                            </b></i>
+
−
                            </div>
+
−
                          <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; padding-bottom: 10px; line-height: 25px;' >
+
−
                            <b>GADD45α_promoter_homo_sapiens  </b>
+
−
                          </div>
+
−
                          <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; line-height: 25px;' >
+
−
TTGAGAAAGGAGAATCTGGGTTGCCAGGGATTCCCACATGTGGTCACCAGCTCCCCACGC
+
−
AGACCAGCTCACGATTTCCCAGTTACACCGGGCAGGTGGGAAACCGTTCTGCTTTCTGTG
+
−
GAAAAGATTCTAACTTGGTTCCCTGCCATCCCTGAATACAAACGGGTTGGTTTTTCTTTTTT
+
−
GAGCTTCCAACCCTTGCAGCTTTCCAAAAATAAATCAAACCAGCCATCAGGGCACCGAAAT
+
−
AATACTACTGCTAATAAGCAGCTTCGCCTAGACTTAGATAAACAACACTTCTGAGGTAAACT
+
−
TTGCCCCGGAGGTCTGGAGACACTTTTTTAATGTAACCTGCTTACTAATAATTACTAGACTT
+
−
CAGTGCATTAACCCTGGAAATAGATTTTAATAGCCACCCCTTAAAACAAAAGACATGAAAAG
+
−
ATAATAAGAAAAAAGTGCCGCAACTATTATAGAAAAACACTTGGCAGCCTGCTTCAGCCCAA
+
−
GCTGAGGCCACCTCTAGCCTCTGCTAAAGCCCCCCACTCCCAATGGTCCCCGCCAACCGG
+
−
ATAAGAGTGCGCGCGGGACCCGCCTTCCCCTCTCGGCACCGCCCCCGCCCCCGCCCCCT
+
−
CGGCTCGCCTCCCGCGTGGCTCCTCCCTTTTCCGCTCCTCTCAACCTGACTCCAGGAGCT
+
−
GGGGTCAAATTGCTGGAGCAGGCTGATTTGCATAGCCCAATGGCCAAGCTGCATGCAAAT
+
−
GAGGCGGAAGGTGGTTGGCTGAGGGTTGGCAGGATAACCCCGGAGAGCGGGGCCCTTTG
+
−
TCCTCCAGTGGCTGGTAGGCAGTGGCTGGGAGGCAGCGGCCCAATTAGTGTCGTGCGGC
+
−
CCGTGGCGAGGCGAGGTCCGGGGAGCGAGCGAGCAAGCAAGGCGGGAGGGGTGGCCG
+
−
GAGCTGCGGCGGCTGGCACAGGAGGAGGAGCCCGGGCGGGCGAGGGGCGGCCGGAGA
+
−
GCGCCAGGGCCTGAGCTGCCGGAGCGGCGCCTGTGAGTGAGTGC
+
−
 
+
−
                          </div>
+
−
 
+
−
                          <div style='padding-top: 20px;'></div>
+
−
                                <div style = 'font-size: 20px;color: #a6d4f4; padding-right: 130PX; line-height: 25px; padding-bottom: 20px;' ><b><i>
+
−
                                  ix. GADD153 promoter
+
−
                                </b></i>
+
−
                                </div>
+
−
                              <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; padding-bottom: 10px; line-height: 25px;' >
+
−
                                <b>GADD153_promoter_cricetulus_griseus  </b>
+
−
                              </div>
+
−
                              <div style = 'padding-left: 40PX; padding-right: 130PX; line-height: 25px;' >
+
−
AGAACAGGAATTCTGGCGTGCAGTGGGCGACTCAGAAACGCCCAAAGGTGCTCCCCCGA
+
−
GACAAGCGGTNGGACTACCATGGAAATGCCAGGACCTCAGCCTCTGGGAAGCGTTAGGAG
+
−
GTTAAAAGAGATGAGATCCCTTCTAAAGGGCTGGAGAAGATGTCAGTCCAGGTAGGACTAA
+
−
TGGAAACTTTATCGCGGTTCCAGGGGCCTCGGNNCGACTGAGCTGGGAGGGGCCGGGAA
+
−
GCTGGGAGTCTGGATGGAGGACGAAGTTGGAGGTGATGGGAGGTGGGTGGGCAGACCG
+
−
CAGCTCCTGGGCAGACAAGTTCAGGAAGGACAGCCGTTGGGGCCGTTGGATACTGGGAG
+
−
CTGGCGCTCCGCCCTCTTCCCTCTCATCCCCCCACCCGCGCCTCCCACCACCGTCGGCG
+
−
GCCCCTGCGCGTGCGCGCGCGCAGACACCGGTTGCCAAACATTGCATCATCCCCGCCCC
+
−
CCGTCATCCCTCCCTCGCCGCACTCTCCTTCGCCCGCCCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGC
+
−
GNGCGCATGACTCACTCACCTCCTCCGCGGAGCCTCGTGACCCAAAGCCACTTCCGGGTC
+
−
CAAGACAACGTAGCTCTCCAGCCAGAGGGCGGGGCGGAGGCGGGGGCCGAGGGGGCTC
+
−
CTGAGTGGCGGATGTAGGGGTGGGGCGGAGTCAGTGCCAGCGTGCCGCTTTCTGATTGG
+
−
CAGGCTCCTGGGTCCCGCCCCCCAAAAGAGGGGACGGGCCCGCATAAAATATCTTCTCTC
+
−
GGCGCTGCAGAGGTCAGTAGCCTGAGTCTCACACTTCGGTC
+
−
 
+
−
                              </div>
+
−
 
+
  
 +
<div style = 'padding-left:7%;padding-bottom: 22px; font-size: 25px; color: #667d9d'; ><b>Supplementary Material</b></div>
  
 +
<center>
 +
    <embed src= " https://static.igem.org/mediawiki/2018/2/2a/T--UC_Davis--newfastaandprimers.pdf" width= "600" height= "400" style ='border-width: 3px;border-color: gray;'>
 +
    </center>
 +
 
  
 +
  <div style='padding-top: 100px;'></div>
  
−
                          <div style='padding-top: 100px;'></div>
 
 
</body>
 
</body>
 
</html>
 
</html>
 
{{Template: UC_Davis/footer}}
 
{{Template: UC_Davis/footer}}

Latest revision as of 00:49, 18 October 2018

iGEM

Supplementary
Supplementary Material
Supplementary Material
iGEM-Footer

Contact

530-752-1139

2240 Academic Surge
Davis,Ca 95616

UC Davis iGEM 2018