Difference between revisions of "Team:Peking/Model"

 
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<head>
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<!--[if (gte IE 8)|!(IE)]><!-->
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<style>
+
<html class="no-js" lang="en">
−
             #home_logo, #sideMenu {
+
    <!--<![endif]-->
−
             display: none;
+
    <head>
 +
        <!--- Basic Page Needs========================================================================= -->
 +
        <meta charset="utf-8"/>
 +
        <title></title>
 +
        <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1.0, maximum-scale=1.2, user-scalable=yes" />
 +
        <meta name="description" content="Wiki of Peking iGEM 2018" />
 +
        <meta name="author" content="Peking iGEM"/>
 +
        <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />
 +
        <!-- Mobile Specific Metas===================================================================== -->
 +
        <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1, maximum-scale=1"/>
 +
        <!-- Fix  Overwrite the original iGEM style=================================================== -->
 +
        <link href="https://2018.igem.org/Template:Peking/css/fix?action=raw&ctype=text/css" rel="stylesheet" />
 +
        <!-- CSS======================================================================================= -->
 +
        <link href="https://2018.igem.org/Template:Peking/css/bootstrap_min?action=raw&ctype=text/css" rel="stylesheet" />
 +
        <link href="https://2018.igem.org/Template:Peking/css/style?action=raw&ctype=text/css" rel="stylesheet" />
 +
        <!-- CSS======================================================================================= -->
 +
        <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Template:Peking/css/default?action=raw&ctype=text/css"/>
 +
        <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Template:Peking/css/layout?action=raw&ctype=text/css"/>
 +
        <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Template:Peking/css/media-queries?action=raw&ctype=text/css"/>
 +
        <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Template:Peking/css/notebook_panel?action=raw&ctype=text/css"/>
 +
        <style>
 +
                        body { background: #D2D8D8 url(https://static.igem.org/mediawiki/2018/7/78/T--Peking--images_bodyBackground.jpeg); background-attachment:fixed;}
 +
             .texttitle{
 +
                color:#6495ED;
 +
                font-size: 32px;
 +
                line-height: 48px;
 +
                margin-bottom: 12px;
 +
                font-family: raleway-bold, sans-serif !important;
 +
                background: transparent;
 +
                letter-spacing: 3px;
 +
                text-transform: uppercase;
 +
                font-weight: 350;
 +
                text-align: center;
 +
                padding-top:40px;
 +
            }
 +
        sup{font-size:11px;}
 +
        .references{margin-top:150px;margin-bottom:40px;}
 +
        .references p{font-size:14px !important; color:#666161 !important;}
 +
        .classic-title {font-weight: 300;padding-top:30px;}
 +
        .classic-title span {
 +
            padding-bottom: 8px;
 +
            border-bottom: 1px solid #383232;
 +
             font-weight: 400;
 
         }
 
         }
−
 
+
        figure{margin-top:40px;margin-bottom:40px;height:auto;}
−
         #sideMenu, #top_title, .patrollink {
+
         .anchor{padding-top:100px;margin-top:-100px;}
−
             display: none;
+
             </style>
 +
       
 +
    </head>
 +
    <body>
 +
        <!--sidebar 引用==============================================================================-->
 +
        <style>
 +
            #primary span{
 +
                display:block;
 +
                word-break:break-all
 +
            }
 +
       
 +
        #page-wrap {
 +
            width: 25%;
 +
            margin: 0px;
 +
            position: relative;
 
         }
 
         }
−
 
+
         #page-wrap a:hover {color:#6495ED;}
−
         #content {
+
       
−
            width: 100%;
+
        #sidebar {
−
            padding: 0px;
+
             width: 25%;
−
             margin-top: 0px;
+
 
             margin-left: 0px;
 
             margin-left: 0px;
−
            margin-right: 0px;
 
 
         }
 
         }
−
 
+
         @media (min-width:1024px){
−
         body {
+
             #sidebar{position:relative;top:120px;max-width:200px;}}
−
             background-color: #FAFAFA;
+
         @media (max-width: 1023px){
−
         !important;
+
            #sidebar{display:none;
 +
            }
 +
            #page-wrap{display:none;}
 
         }
 
         }
−
 
+
        </style>
−
         #bodyContent h1, #bodyContent h2, #bodyContent h3, #bodyContent h4, #bodyContent h5 {
+
          
−
             margin-bottom: 0px;
+
       
 +
        <script type="text/javascript">
 +
            function menuFixed(id){
 +
                var obj = document.getElementById(id);
 +
                var _getHeight = obj.offsetTop;
 +
               
 +
                window.onscroll = function(){
 +
                    changePos(id,_getHeight);
 +
                }
 +
            }
 +
        function changePos(id,height){
 +
            var obj = document.getElementById(id);var windowBottom = $(window).scrollTop() + $(window).innerHeight();
 +
            if(w>=1024){
 +
                if($(window).scrollTop() + $(window).height() > $(document).height() - 230){
 +
                    $('#sidebar').fadeOut("fast");}else{$('#sidebar').fadeIn("fast");}
 +
             }
 +
            var scrollTop = document.documentElement.scrollTop || document.body.scrollTop -230;
 +
            var windowBottom = $(window).scrollTop() + $(window).innerHeight();
 +
            var w = window.innerWidth;
 +
           
 +
            if(scrollTop < height){ obj.style.position = 'relative';
 +
            }else{
 +
                obj.style.position = 'fixed';
 +
            }
 
         }
 
         }
−
a:link {
+
        </script>
−
                        text-decoration: none;
+
       
−
                    }
+
        <script type="text/javascript">
 +
            window.onload = function(){
 +
                menuFixed('sidebar');
 +
            }
 +
        </script>
 +
        <script>
 +
            function naver(id){
 +
                var obj=document.getElementById(id);
 +
                var oPos=obj.offsetTop;
 +
                return window.scrollTo(0,oPos+250);
 +
            }
 +
        </script>
 +
        <!--sidebar 引用 end ==============================================================================-->
 +
        <!--panel 引用==================================================================================-->
 +
        <style type="text/css">
 +
            .panel-default .panel-heading a{
 +
                text-decoration: none;
 +
                display:block;
 +
                padding:10px;
 +
            }
 +
        .panel-heading.panel-title{
 +
            text-decoration: none;
 +
            padding-top:0px;
 +
            padding-bottom:0px;
 +
            padding-left:0px;
 +
            padding-right:0px;
 +
            text-align:center;
 +
            font-size:19px;
 +
           
 +
        }
 +
        a[aria-expanded="true"] {
 +
            background-color:rgba(70, 73, 76, 0.95);
 +
            text-decoration: none;
 +
            color:white;
 +
        }
 +
       
 +
        .panel-default .panel-heading a[aria-expanded="false"]{
 +
            -o-transition: background-color 1s linear;
 +
            -moz-transition: background-color 1s linear;
 +
            -khtml-transition: background-color 1s linear;
 +
            -webkit-transition: background-color 1s linear;
 +
            -ms-transition: background-color 1s linear;
 +
            transition: background-color 1s linear;
 +
        }
 +
        .panel-default .panel-heading a[aria-expanded="false"]:hover{
 +
            background-color:rgba(70, 73, 76, 0.95);
 +
            text-decoration: none;
 +
            color:white;
 +
        }
 +
        .panel-default .panel-heading a[aria-expanded="true"]{
 +
            -o-transition: opacity 1s linear;
 +
            -moz-transition: opacity 1s linear;
 +
            -khtml-transition: opacity 1s linear;
 +
            -webkit-transition: opacity 1s linear;
 +
            -ms-transition: opacity 1s linear;
 +
            transition: opacity 0.7s linear;
 +
        }
 +
        .panel-default .panel-heading a[aria-expanded="true"]:hover{
 +
            opacity:0.7;
 +
        }
 +
       
 +
        .coll p a{
 +
            color:#6495ED !important;
 +
        }
 +
        .coll p a:hover{
 +
            color:#6495ED !important;
 +
        }
 +
        .coll {
 +
            width:100%;
 +
            float:left;
 +
        }
 +
        .coll .info {
 +
            width:6%;
 +
            font-size:11px;
 +
            color:#a4a4a4;
 +
            margin-top:0px;
 +
            float:left;
 +
           
 +
        }
 +
        .coll .content {
 +
            width:94%;
 +
            float:left;
 +
            margin-left:40px;
 +
            margin-top:-3px;
 +
        }
 +
        .coll .ordi {
 +
            width;100%;
 +
            margin:0px 0px 0px 0px;
 +
            font-size:35px;
 +
            font-style:italic;
 +
            float:left;
 +
            color:#11abb0;
 +
            opacity:0.8;
 +
        }
 +
       
 +
            </style>
 +
       
 +
        <script type="text/javascript">
 +
            $(document).ready(function(){
 +
                              $("#button1").click(function(){
 +
                                                  $(".panel-collapse").collapse("show");
 +
                                                  });
 +
                              });
 +
                              $(document).ready(function(){
 +
                                                $("#button2").click(function(){
 +
                                                                    $(".panel-collapse").collapse("hide");
 +
                                                                    });
 +
                                                });
 +
                                                $("#notebook").addClass("navbar-active");
 +
            </script>
 +
        <!--panel 引用 end ==================-->
 +
       
 +
          <!-- Navigation -->
 +
        <div id="navigation" class="navbar navbar-fixed-top">
 +
            <div class="navbar-inner ">
 +
                <div class="container no-padding">
 +
                    <a class="show-menu" data-toggle="collapse" data-target=".nav-collapse"><span class="show-menu-bar"></span>
 +
                    </a>
 +
                    <div id="logo" style="max-width:0px"><a class="" href="https://2018.igem.org/Team:Peking"><img
 +
                    src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/3/36/T--Peking--Logo.png"></a></div>
 +
                 
 +
                    <div class="nav-collapse collapse">
 +
                        <ul class="nav">                         
  
−
                    a:visited {
+
                            <li class="menu-1"><a class="colapse-menu1" href="https://2018.igem.org/Team:Peking">Home</a>
−
                        text-decoration: none;
+
                            </li>
−
                    }
+
  
−
                    a:active {
+
                            <li class="dropdown menu-2"><a class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" href="#" >Project</a>
−
                        text-decoration: none;
+
                                <ul class="dropdown-menu">
−
                    }
+
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Project" class="barfont1">Description</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Design" class="barfont1">Design</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Demonstrate" class="barfont1">Demonstration</a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Perspective" class="barfont1">Perspective</a></li>
 +
                                </ul>
 +
                            </li>
 +
                            <li class="menu-3"><a class="colapse-menu1" href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Model">Modeling</a>
 +
                            </li>
 +
                            <li class="menu-4"><a class="colapse-menu1" href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Software">Software</a>
 +
                            </li>
  
−
                    a:hover {
 
−
                    }
 
−
.dropbtn {
 
−
    background-color: #4CAF50;
 
−
    color: white;
 
−
    padding: 16px;
 
−
    font-size: 16px;
 
−
    border: none;
 
−
    cursor: pointer;
 
−
}
 
  
−
.dropdown {
+
                            <li class="menu-6"><a class="colapse-menu1" href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Human_Practices">Human Practices</a>
−
    position: relative;
+
                            </li>
−
    display: inline-block;
+
                                <li class="dropdown menu-7"><a class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" href="#" >Achievement</a>
−
}
+
                                    <ul class="dropdown-menu">
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Judging_Form" class="barfont1">Judging Form</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Parts" class="barfont1">Parts</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Improve" class="barfont1">Improvement</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/InterLab" class="barfont1">InterLab</a></li>
  
−
.dropdown-content {
+
                                    </ul>
−
    display: none;
+
                                </li>
−
    position: absolute;
+
                                <li class="dropdown menu-8"><a class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" href="#" >Lab</a>
−
    background-color: #f9f9f9;
+
                                    <ul class="dropdown-menu">
−
    min-width: 100px;
+
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Team_Members">Team Members</a></li>
−
    box-shadow: 0px 8px 16px 0px rgba(0,0,0,0.2);
+
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Attributions" class="barfont1">Attributions</a></li>
−
}
+
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Notebook" class="barfont1">Notebook</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Collaborations" class="barfont1">Collaborations</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Safety" class="barfont1">Safety</a></li>
 +
                                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Acknowledgement" class="barfont1">Acknowledgement</a></li>
 +
                                       
 +
                                    </ul>
 +
                                </li>
 +
                                </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
        </div>
 +
        <!--/Navigation -->
 +
       
 +
       
 +
        <!-- Page Title======================================================================== -->
 +
        <div id="page-title">
 +
            <div class="row">
 +
                <div class="twelve columns centered text-center">
 +
                    <h1>Modeling</h1>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
        </div><!-- Page Title End-->
 +
        <div id="page-content" class="row page">
 +
            <div id="primary" class="twelve columns">
 +
                <section>
 +
                    <div class="row">
 +
                       
 +
                       
 +
                       
 +
                       
 +
                        <div class="three columns">
 +
                            <div id="page-wrap">
 +
                                <div id="sidebar" style="color:#000000">
 +
                                    <h4><a href="javascript:void(0);" onclick="naver('A')">&bull;Overview</a></h4>
 +
                                    <h4><a href="javascript:void(0);" onclick="naver('B')">&bull;SPOT&#160;Formation</a></h4>
 +
                                    <h4><a href="javascript:void(0);" onclick="naver('C')">&bull;Regulation</a></h4>
 +
                                    <h4><a href="https://static.igem.org/mediawiki/2018/3/30/T--Peking--Modelling_Revise.pdf">&bull;PDF&#160;Version&#160;Download</a></h4>                                 
 +
                                </div>
 +
                            </div>
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                        </div>
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−
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                            <div class="texttitle"><a id="A"></a>Overview
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     <div class="texttitle"><a id="B"></a>SIMULATION FOR PHASE SEPARATION
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<br/></div>
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                            </div>
 +
<div class="texttitle"><a id="C"></a>Simulation for metabolic regulation with phase separation
  
−
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+
                                    <p> You can see the pdf version of our modelling <a href="https://static.igem.org/mediawiki/2018/9/9e/T--Peking--Modeling.pdf"> here</a></p>
−
#LeftNavigation{position:fixed; top:80px; float:left; width:200px; height:100%; background-color:#313131; z-index:1050;}
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−
 
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−
 
+
<object  class="center" data="https://static.igem.org/mediawiki/2018/9/9e/T--Peking--Modeling.pdf" style="height: 626px; width: 602px; margin-top: 48px; margin-right: 0px;margin-left: 0px; float: left" max-width="600px" max-height="100px"><p>no pdf, download here<a href="https://static.igem.org/mediawiki/2018/9/9e/T--Peking--Modeling.pdf">click here to
−
/*end of Major body*/
+
  download the PDF file.</a></p>   </object>
−
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              style="color: #000000; font-size: x-large"><strong>Peking iGEM 2018</strong></a>
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                    <a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Team_Members">Team Members</a>
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+
                       
−
                 <li class="Left"><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Dry_Lab"><b>Dry Lab</b></a></li><br/><br/>
+
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−
                <li class="Left"><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Model">>&#160;&#160;&#160;Model</a><li>
+
                   
−
                    <li class="Left"><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Model">&#160;&#160;&#160;&#8226;Phase&#160;separation</a><li>
+
                                   
−
                    <li class="Left"><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Model">&#160;&#160;&#160;&#8226;Function</a><li>
+
                   
−
                <li class="Left"><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking/Software">&#9674;&#160;&#160;&#160;Software</a><li>
+
                    </div><!--row end-->
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          </ul>
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        </div><!--12 columes end-->
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                            <a href="http://dean.pku.edu.cn/pkudean/index.html"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/7/7a/T--Peking--images_PKU_Administration_logo.png"></a>
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 +
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                    </ul>
−
<p>Welcome to our wiki!</p>
+
                </div>
−
 
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                <div class="twelve columns" >
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Model
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                        <!--<li>&copy; 2014 Sparrow</li> -->
−
</div>
+
                        <li><a href="https://2018.igem.org/Team:Peking">Home</a>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:pekingigem2018@126.com">Contact</a></li>
−
</div>
+
                        <span> &copy;2018 PEKING IGEM. All Rights Reserved.</span>
 +
                        <li><a href="http://getbootstrap.com/2.3.2/">Based on Bootstrap</a></li>
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                    </ul>
 +
                </div>
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                <div id="go-top" style="display: block;"><a title="Back to Top" href="#">Go To Top</a></div>
 +
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            <!-- Java Script======================================================================= -->
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            <script>window.jQuery || document.write('<script src="https://2018.igem.org/Template:Peking/Javascript/jquery_1_10_2_min?action=raw&ctype=text/javascript"><\/script>')</script>
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            <script type="text/javascript" src="https://2018.igem.org/Template:Peking/Javascript/jquery_migrate_1_2_1_min?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
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            <script src="https://2018.igem.org/Template:Peking/Javascript/jquery_flexslider?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
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            <!--quotations from flexslider: start-->
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            <script src='https://2018.igem.org/Template:Peking/Javascript/modernizr_js?action=raw&ctype=text/javascript'></script>
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                <script type='text/javascript' src='https://2018.igem.org/Template:Peking/Javascript/fjquery_polaroid?action=raw&ctype=text/javascript'></script>
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                <script type='text/javascript' src='https://2018.igem.org/Template:Peking/Javascript/fjquery_easing?action=raw&ctype=text/javascript'></script>
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                <script type='text/javascript' src='https://2018.igem.org/Template:Peking/Javascript/fjquery_transform_0_8_0_min?action=raw&ctype=text/javascript'></script>
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                <!--quotations from flexslider: end-->
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                <!--quotations from black: start-->
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                <script type='text/javascript' src="https://2018.igem.org/Template:Peking/Javascript/jquery_patallax_1_1_3?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
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                <script type='text/javascript' src="https://2018.igem.org/Template:Peking/Javascript/appear?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
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                <script type='text/javascript' src="https://2018.igem.org/Template:Peking/Javascript/modernizr?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
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                <script type='text/javascript' src="https://2018.igem.org/Template:Peking/Javascript/jquery_bxslider_min?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
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                <script type='text/javascript' src="https://2018.igem.org/Template:Peking/Javascript/scripts?action=raw&ctype=text/javascript "></script>
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                <!--quotations from black: end-->
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                            </body>
 
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Latest revision as of 03:04, 18 October 2018

Modeling

Overview
SIMULATION FOR PHASE SEPARATION

Simulation for metabolic regulation with phase separation

You can see the pdf version of our modelling here