Difference between revisions of "Team:SJTU-BioX-Shanghai/Loader"

 
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"/>
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                    <a title="Go to story page" href="https://2018.igem.org/Team:SJTU-BioX-Shanghai/Story"><img class="content_nav_b_story_badge" src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/d/d0/T--SJTU-BioX-Shanghai--story_badge.png"></a>
 
                 </div>
 
                 </div>
  
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         <div class="text">
 
         <div class="text">
 
             <h1>Loader</h1>
 
             <h1>Loader</h1>
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             <p>In spite of test in vitro and in vivo, we also took our first step to make ECHO a real product.
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                <a id="section1">
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             </p>
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                    <span class="place_holder"></span>
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                    Section1
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                </a>
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            </h2>
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             <p><strong>Instructions: you have the change not only the main text, but also have to modify the text in the navgation bar on the left side. Now put your content here and do the same for the following sections. </strong>xxx xxx xxx xxx xxx  xxx xxx xxx xxx xxx  xxx xxx xxx xxx xxx  xxx xxx xxx xxx xxx  xxx xxx xxx xxx xxx  xxx xxx xxx xxx xxx  xxx xxx xxx xxx xxx  xxx xxx xxx xxx xxx  xxx xxx xxx xxx xxx  xxx xxx xxx xxx xxx  xxx xxx xxx xxx xxx  xxx xxx xxx xxx xxx Note template is here ---
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                <span class="footnote_link">OD
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                    <span class="footnote">
+
−
                        <span class="footnote_header">OD</span>
+
−
                        <span class="footnote_txt">Optical density</span>
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                    </span>
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                </span>
+
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             .</p>
+
 
              
 
              
−
             <h2>
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             <h3>
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                 <a id="section2">
+
                 ECHO Capsules
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                    <span class="place_holder"></span>
+
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                    Section2
+
 
                 </a>
 
                 </a>
−
             </h2>
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             </h3>
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             <p>xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxxxxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxxxxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx
+
             <p>After we visited Roche with Tongji_China, we have been thinking about the proper load of ECHO. In our interview with Lingjie Zhou, who is responsible for quality assurance in Roche, she talked about the advantage of capsules compared with other pharmaceutical preparations, which are listed below.
 
             </p>
 
             </p>
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             <!--*********************** list-elements template ***********************-->
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            <h2>
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<ul class="list-elements" >
−
                <a id="section3">
+
<li>High bioavailability </li>
−
                    <span class="place_holder"></span>
+
        <li>Reliable stability</li>
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                    Section3
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        <li>Flexible form</li>
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        <li>Good compliance of patients</li>
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        <li>Easy manufacture</li>
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</ul>
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<!--*********************** list-elements template ends ***********************-->
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<p>More about our <a title="interview with Roche" href="https://2018.igem.org/Team:SJTU-BioX-Shanghai/Human_Practices">interview with Roche</a>.
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</p>
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<p>After the visit, we decided to collaborate with Tongji_China, to purchase the enteric capsule, DRcaps, from <a href="https://www.capsugel.com/">Capsugel</a>, a global pharmaceutical dosage solutions company. This kind of capsule can protect product ingredients form stomach acid so that it can release ECHO in colon where our device is supposed to function.
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<!--******************************Fig 1****************************-->
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<div class="img_in_text zoom_out_able">            
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<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/c/c1/T--SJTU-BioX-Shanghai--capsule.png"/>
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    <p class="fig_illustration">Fig 1.  ECHO capsules.</p>
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</div>
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<h3>
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                Hydrogel beads
 
                 </a>
 
                 </a>
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             </h2>
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             </h3>
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             <p>xxx  xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx. The text-link template is here.</p>
+
             <p>Alginates are linear natural polysaccharide which could respond to the calcium and produce a three-dimensional (3D) network of chain cross linking, serving as promising materials for drug delivery. This time we introduced sodium alginates to make hydrogel covered bacteria beads, which was suspended in drinking water, facilitating oral administration of our engineered bacteria.<br>
−
            <a title="https://static.igem.org/mediawiki/2018/0/09/2018_InterLab_Plate_Reader_Protocol.pdf" href="https://static.igem.org/mediawiki/2018/0/09/2018_InterLab_Plate_Reader_Protocol.pdf">2018 Interlab Plate Reader Protocol</a> <br/>
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The strenghs of hydrogel beads are
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            <a title="http://parts.igem.org/Help:Protocols/Transformation" href="http://parts.igem.org/Help:Protocols/Transformation">Protocols/Transformation</a>
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            <!--******************************Fig 1****************************-->
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            <div class="img_in_text zoom_out_able">             
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                    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/6/64/T--SJTU-BioX-Shanghai--interlab_Fig1.jpg"/>
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                    <p class="fig_illustration">Fig 1. The particle standard curve obtained form the 2nd calibration experiment.</p>
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            </div>
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            <p> xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx xxx.</p>
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<p>The table template is here.</p>
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             </p>
−
           
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             <!--*********************** list-elements template ***********************-->
−
         
+
<ul class="list-elements" >
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<li>Easy to produce food grade beads </li>
−
           
+
        <li>Stable for <i>E.coli</i> delivery </li>
−
             <!--*****************************Table 1****************************-->
+
        <li>Adjustable to produce different sizes </li>
−
            <div class="table_in_text">
+
        <li>Safe to degradation in vivo </li>
−
                <p class="table_illustration">Table 1. Colony forming units per 0.1 OD<sub>600</sub></p>
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            <table style="border-collapse: collapse; ">
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                <tr style="border-top:2px solid #000;">
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−
                    <th rowspan="2">samples</th>
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                    <th colspan="3">dilution factor</th>
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                    <th rowspan="2">CFU/mL</th>
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−
               
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                <tr>
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                    <td>8&times;10<sup>4</sup></td>
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                    <td>8&times;10<sup>5</sup></td>
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                    <td>8&times;10<sup>6</sup></td>
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                </tr>
+
−
         
+
−
                <tr style="border-top:2px solid #000;">
+
−
                    <td>1.1</td> <td>TNTC</td> <td>48</td> <td>11</td> <td>3.84E+07</td>
+
−
                </tr>
+
−
                <tr>
+
−
                    <td>1.2</td> <td>248</td> <td>41</td> <td>10</td> <td>3.28E+07</td>
+
−
                </tr>
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−
                <tr>
+
−
                    <td>1.3</td> <td>172</td> <td>54</td> <td>5</td> <td>4.32E+07</td>
+
−
                </tr>
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                <tr>
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                    <td>2.1</td> <td>TNTC</td> <td>143</td> <td>20</td> <td>1.14E+08</td>
+
−
                </tr>
+
−
                <tr>
+
−
                    <td>2.2</td> <td>TNTC</td> <td>153</td> <td>25</td> <td>1.22E+08</td>
+
−
                </tr>   
+
−
                <tr>
+
−
                    <td>2.3</td> <td>TNTC</td> <td>151</td> <td>18</td> <td>1.21E+08</td>
+
−
                </tr>
+
−
                <tr>
+
−
                    <td>3.1</td> <td>TNTC</td> <td>119</td> <td>16</td> <td>9.52E+07</td>
+
−
                </tr>
+
−
                <tr>
+
−
                    <td>3.2</td> <td>TNTC</td> <td>125</td> <td>19</td> <td>1.00E+08</td>
+
−
                </tr>
+
−
                <tr>
+
−
                    <td>3.3</td> <td>TNTC</td> <td>89</td> <td>18</td> <td>7.12E+07</td>
+
−
                </tr>
+
−
                <tr>
+
−
                    <td>4.1</td> <td>TNTC</td> <td>209</td> <td>16</td> <td>1.67E+08</td>
+
−
                </tr> 
+
−
                <tr>
+
−
                    <td>4.2</td> <td>TNTC</td> <td>130</td> <td>17</td> <td>1.04E+08</td>
+
−
                </tr>
+
−
                <tr style="border-bottom:2px solid #000;">
+
−
                    <td>4.3</td> <td>TNTC</td> <td>164</td> <td>10</td> <td>1.31E+08</td>
+
−
                </tr>  
+
  
−
            </table>
+
</ul>
−
            </div>
+
</h3>
−
              
+
             <p>
−
           
+
The overall process of hydrogel beads production was shown in Fig.2. </p>
−
           
+
 
−
            <h2>
+
<!--******************************illustration of hydrogel introduction****************************-->
−
                <a id="section5">
+
 
−
                    <span class="place_holder"></span>
+
<div class="img_in_text zoom_out_able">            
−
                    Section5
+
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/1/1d/T--SJTU-BioX-Shanghai--illustration_of_hydrogel.png"/>
−
                </a>
+
    <p class="fig_illustration">Fig 2. Illustration of bacteria loaded hydrogel.</p>
−
            </h2>
+
</div>
−
            <p>XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX  XXX </p>
+
 
−
           
+
<!--****************************************************************-->
 +
<!--****************************** hydrogel ****************************-->
  
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<div class="img_in_text zoom_out_able">             
 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/d/d7/T--SJTU-BioX-Shanghai--hydrogel.png"/>
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    <p class="hydrogel">Fig 3. Hydrogel beads loaded with engineered bacteria.</p>
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</div>
  
 +
<!--****************************************************************-->
  
  

Latest revision as of 14:55, 5 December 2018

Loader

In spite of test in vitro and in vivo, we also took our first step to make ECHO a real product.

ECHO Capsules

After we visited Roche with Tongji_China, we have been thinking about the proper load of ECHO. In our interview with Lingjie Zhou, who is responsible for quality assurance in Roche, she talked about the advantage of capsules compared with other pharmaceutical preparations, which are listed below.

  • High bioavailability
  • Reliable stability
  • Flexible form
  • Good compliance of patients
  • Easy manufacture

More about our interview with Roche.

After the visit, we decided to collaborate with Tongji_China, to purchase the enteric capsule, DRcaps, from Capsugel, a global pharmaceutical dosage solutions company. This kind of capsule can protect product ingredients form stomach acid so that it can release ECHO in colon where our device is supposed to function.

Fig 1. ECHO capsules.

Hydrogel beads

Alginates are linear natural polysaccharide which could respond to the calcium and produce a three-dimensional (3D) network of chain cross linking, serving as promising materials for drug delivery. This time we introduced sodium alginates to make hydrogel covered bacteria beads, which was suspended in drinking water, facilitating oral administration of our engineered bacteria.
The strenghs of hydrogel beads are

  • Easy to produce food grade beads
  • Stable for E.coli delivery
  • Adjustable to produce different sizes
  • Safe to degradation in vivo

The overall process of hydrogel beads production was shown in Fig.2.

Fig 2. Illustration of bacteria loaded hydrogel.

Fig 3. Hydrogel beads loaded with engineered bacteria.