Difference between revisions of "Team:NCKU Tainan/Hardware"

Line 16: Line 16:
 
                 <div class="col-2 side">
 
                 <div class="col-2 side">
 
                     <div id="sidelist" class="list-group">
 
                     <div id="sidelist" class="list-group">
                         <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#list-item-1">Accomplishment</a>
+
                         <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#Accomplishment">Accomplishment</a>
                         <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#list-item-2">Introduction</a>
+
                         <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#Introduction">Introduction</a>
                         <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#list-item-3">Device design</a>
+
                         <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#Device_design">Device design</a>
                         <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#list-item-4">Bioreactor</a>
+
                         <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#Bioreactor">Bioreactor</a>
                         <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#list-item-5">Nutrient tank</a>
+
                         <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#Nutrient_tank">Nutrient tank</a>
                         <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#list-item-6">Materials required</a>
+
                         <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#Materials_required">Materials required</a>
 
                         <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#"><i class="fa fa-arrow-up fa-1x"
 
                         <a class="list-group-item list-group-item-action" href="#"><i class="fa fa-arrow-up fa-1x"
 
                                 aria-hidden="true"></i></a>
 
                                 aria-hidden="true"></i></a>
Line 31: Line 31:
  
  
                             <div id="list-item-1">
+
                             <div id="Accomplishment">
 
                                 </br></br></br>
 
                                 </br></br></br>
 
                                 <h3>Accomplishment</h3>
 
                                 <h3>Accomplishment</h3>
Line 40: Line 40:
 
                                     <li>Implemented Bio-safety to our device.</li>
 
                                     <li>Implemented Bio-safety to our device.</li>
 
                                     <li>Integrated with <a href="https://2018.igem.org/Team:NCKU_Tainan/Model" style="color:#28ff28;">modeling</a>.</li>
 
                                     <li>Integrated with <a href="https://2018.igem.org/Team:NCKU_Tainan/Model" style="color:#28ff28;">modeling</a>.</li>
                                     <li>Installation of sensors: pH Meter, Temperature Sensor, CO<sub>2</sub> Sensor and Wi-Fi Sensor.</li>
+
                                     <li>Installation of sensors: pH Meter, Temperature Sensor, CO<sub>2</sub> Sensor
 +
                                        and Wi-Fi Sensor.</li>
 
                                 </ol>
 
                                 </ol>
 
                             </div>
 
                             </div>
  
  
                             <div id="list-item-2">
+
                             <div id="Introduction">
 
                                 </br></br></br>
 
                                 </br></br></br>
 
                                 <h3>Introduction</h3>
 
                                 <h3>Introduction</h3>
Line 59: Line 60:
 
                                         industrial IGCC system. And we used the Arduino to sense the <a href="#list-item-6"
 
                                         industrial IGCC system. And we used the Arduino to sense the <a href="#list-item-6"
 
                                             style="color:#28ff28;">pH</a>,
 
                                             style="color:#28ff28;">pH</a>,
                                         <a href="#list-item-7" style="color:#28ff28;">CO<sub>2</sub> concentration</a> and <a href="#list-item-8"
+
                                         <a href="#list-item-7" style="color:#28ff28;">CO<sub>2</sub> concentration</a>
                                            style="color:#28ff28;">temperature</a> then use the <a href="#list-item-9"
+
                                        and <a href="#list-item-8" style="color:#28ff28;">temperature</a> then use the
                                            style="color:#28ff28;">wi-fi
+
                                        <a href="#list-item-9" style="color:#28ff28;">wi-fi
 
                                             sensor</a> to upload to the <a href="https://2018.igem.org/Team:NCKU_Tainan/Software#list-item-3"
 
                                             sensor</a> to upload to the <a href="https://2018.igem.org/Team:NCKU_Tainan/Software#list-item-3"
 
                                             style="color:#28ff28;">database</a>.Last but not least, we can monitor the
 
                                             style="color:#28ff28;">database</a>.Last but not least, we can monitor the
Line 70: Line 71:
  
  
                             <div id="list-item-3">
+
                             <div id="Device_design">
 
                                 </br></br></br>
 
                                 </br></br></br>
 
                                 <h3>Device design</h3>
 
                                 <h3>Device design</h3>
Line 97: Line 98:
  
  
                             <div id="list-item-4">
+
                             <div id="Bioreactor">
 
                                 </br></br></br>
 
                                 </br></br></br>
 
                                 <h3>Bioreactor</h3>
 
                                 <h3>Bioreactor</h3>
 
                                 <div id="pt">
 
                                 <div id="pt">
                                  <p class="pcontent">We developed a closed bioreactor system and implemented online monitoring system
+
                                    <p class="pcontent">We developed a closed bioreactor system and implemented online
                                    which can live monitoring several environmental parameters. Here is the detail of our bioreactor.</p>
+
                                        monitoring system
 +
                                        which can live monitoring several environmental parameters. Here is the detail
 +
                                        of our bioreactor.</p>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
 
                                 <div class="carousel-item active" style="background-image: url('http://placehold.it/1900x1080')"></div>
 
                                 <div class="carousel-item active" style="background-image: url('http://placehold.it/1900x1080')"></div>
 
                                 <div id="pt">
 
                                 <div id="pt">
                                  <p class="pcontent">Gas inlet port are located on the bioreactor’s lower part while outlet port are
+
                                    <p class="pcontent">Gas inlet port are located on the bioreactor’s lower part while
                                    located on the bioreactor’s upper lid. As low concentration CO2 enters the bioreactor, it flows
+
                                        outlet port are
                                    through the diffuser refiner and dissolves in the buffered medium to form acid. A pH sensor and
+
                                        located on the bioreactor’s upper lid. As low concentration CO2 enters the
                                    temperature sensor is installed to monitor the bioreactor tank for further control implementation.
+
                                        bioreactor, it flows
                                    Besides, the CO2 concentration level of exhaust gas is monitored by a CO2 gas sensor, which is
+
                                        through the diffuser refiner and dissolves in the buffered medium to form acid.
                                    mounted on the upper lid. These sensor’s output is connected to an Arduino analog input and sensor
+
                                        A pH sensor and
                                    readings are displayed on a serial LCD which is attached on the lid of bioreactor. The data is then
+
                                        temperature sensor is installed to monitor the bioreactor tank for further
                                    uploaded in real time to a web server via WiFi by using Arduino WiFi Shield.</br></p>
+
                                        control implementation.
 +
                                        Besides, the CO2 concentration level of exhaust gas is monitored by a CO2 gas
 +
                                        sensor, which is
 +
                                        mounted on the upper lid. These sensor’s output is connected to an Arduino
 +
                                        analog input and sensor
 +
                                        readings are displayed on a serial LCD which is attached on the lid of
 +
                                        bioreactor. The data is then
 +
                                        uploaded in real time to a web server via WiFi by using Arduino WiFi Shield.</br></p>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
 
                                 </br>
 
                                 </br>
Line 119: Line 129:
 
                                 <div class="carousel-item active" style="background-image: url('http://placehold.it/1900x1080')"></div>
 
                                 <div class="carousel-item active" style="background-image: url('http://placehold.it/1900x1080')"></div>
 
                                 <div id="pt">
 
                                 <div id="pt">
                                  <p class="pcontent">To prevent sedimentation of cells at the bottom of bioreactor, we build our own
+
                                    <p class="pcontent">To prevent sedimentation of cells at the bottom of bioreactor,
                                    3D printed slow speed magnetic stirrer which permits gentle mixing of microcarrier cell cultures.
+
                                        we build our own
                                    The 3D printed magnet bed is designed specifically for two magnets and can be fitted on the DC
+
                                        3D printed slow speed magnetic stirrer which permits gentle mixing of
                                    motor. The stirrer works by using a DC motor to spin two magnets with opposite polarity, which
+
                                        microcarrier cell cultures.
                                    could create a magnetic field in the bioreactor and cause the stir bar to spin and mix the
+
                                        The 3D printed magnet bed is designed specifically for two magnets and can be
                                    contents. For controlling the speed of the DC motor, we use Arduino and L298N to control the input
+
                                        fitted on the DC
                                    voltage to the motor by using PWM signal.</p>
+
                                        motor. The stirrer works by using a DC motor to spin two magnets with opposite
 +
                                        polarity, which
 +
                                        could create a magnetic field in the bioreactor and cause the stir bar to spin
 +
                                        and mix the
 +
                                        contents. For controlling the speed of the DC motor, we use Arduino and L298N
 +
                                        to control the input
 +
                                        voltage to the motor by using PWM signal.</p>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
                              </div>
+
                            </div>
               
+
 
                              <div id="list-item-5">
+
                            <div id="list-item-5">
 
                                 </br></br></br>
 
                                 </br></br></br>
                                 <h3>Nutrient tank(尚未完成)</h3>
+
                                 <h3>Nutrient tank</h3>
 
                                 <div id="pt">
 
                                 <div id="pt">
                                  <p class="pcontent">The nutrients are pumped into the growth chamber at a rate proportional to the
+
                                    <p class="pcontent">Besides, we also implemented fed-batch culture system in our
                                    growth factor of the culture, which is determined experimentally through the doubling time of the
+
                                        design. Nutrients are fed to the bioreactor during cultivation to prevent
                                    particular bacterial strain.</p>
+
                                        nutrient depletion. The nutrients are pumped into the growth chamber at a rate
 +
                                        proportional to the growth factor of the culture, which is determined
 +
                                        experimentally through the doubling time of the particular bacterial strain.</p>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
                              </div>
+
                            </div>
  
  
                              <div id="list-item-6">
+
                            <div id="Materials_required">
 
                                 </br></br></br></br>
 
                                 </br></br></br></br>
 
                                 <h3>Materials required</h3>
 
                                 <h3>Materials required</h3>
 
                                 <div id="pt">
 
                                 <div id="pt">
                                  <ul>
+
                                    <ul>
                                    <li>Acrylic Sheet</li>
+
                                        <li>Acrylic Sheet</li>
                                    <li>Arduino UNO</li>
+
                                        <li>Arduino UNO</li>
                                    <li>Power Supply</li>
+
                                        <li>Power Supply</li>
                                    <li>Batteries</li>
+
                                        <li>Batteries</li>
                                    <li>Rotameter</li>
+
                                        <li>Rotameter</li>
                                    <li>pH meter</li>
+
                                        <li>pH meter</li>
                                    <li>Thermometer(DS18B20)</li>
+
                                        <li>Thermometer(DS18B20)</li>
                                    <li>CO2 sensor(MG811)</li>
+
                                        <li>CO2 sensor(MG811)</li>
                                    <li>Wi-fi sensor(ESP8266 NodeMcu)</li>
+
                                        <li>Wi-fi sensor(ESP8266 NodeMcu)</li>
                                    <li>Geared DC Motor</li>
+
                                        <li>Geared DC Motor</li>
                                    <li>Tubes</li>
+
                                        <li>Tubes</li>
                                    <li>Magnets</li>
+
                                        <li>Magnets</li>
                                    <li>3D Printed Structure</li>
+
                                        <li>3D Printed Structure</li>
                                    <li>Nuts and Screws</li>
+
                                        <li>Nuts and Screws</li>
                                    <li>Wires</li>
+
                                        <li>Wires</li>
                                    <li>Pumps</li>
+
                                        <li>Pumps</li>
                                  </ul>
+
                                    </ul>
                                  </br></br></br></br>
+
                                    </br></br></br></br>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
                              </div>
+
                            </div>
  
 
                         </div>
 
                         </div>
Line 173: Line 191:
 
     </div>
 
     </div>
  
                <script>
+
    <script>
                    $(document).ready(function () {
+
        $(document).ready(function () {
                        $(window).scroll(function () {
+
            $(window).scroll(function () {
                            if ($(this).scrollTop() >= 90) {
+
                if ($(this).scrollTop() >= 90) {
                                var position = $("#sidelist").position();
+
                    var position = $("#sidelist").position();
                                if (position == undefined) {} else {
+
                    if (position == undefined) {} else {
                                    $('#sidelist').css({
+
                        $('#sidelist').css({
                                        "position": "fixed",
+
                            "position": "fixed",
                                        "top": "145px",
+
                            "top": "145px",
                                        "margin-top": "0px"
+
                            "margin-top": "0px"
                                    });
+
                                }
+
                            } else {
+
                                $('#sidelist').removeAttr('style');
+
                            }
+
                        });
+
                        $(function () {
+
                            $('i.fa-arrow-up').click(function () {
+
                                $('html, body').animate({
+
                                    scrollTop: 0
+
                                }, 600);
+
                                return false;
+
                            });
+
 
                         });
 
                         });
                     });
+
                     }
                 </script>
+
                } else {
 +
                    $('#sidelist').removeAttr('style');
 +
                 }
 +
            });
 +
            $(function () {
 +
                $('i.fa-arrow-up').click(function () {
 +
                    $('html, body').animate({
 +
                        scrollTop: 0
 +
                    }, 600);
 +
                    return false;
 +
                });
 +
            });
 +
        });
 +
    </script>
 
     <script src="https://2018.igem.org/Team:NCKU_Tainan/js/frame/T--NCKU_Tainan--jquery-1_12_4_min_js?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>
 
     <script src="https://2018.igem.org/Team:NCKU_Tainan/js/frame/T--NCKU_Tainan--jquery-1_12_4_min_js?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>
 
     <script src="https://2018.igem.org/Template:NCKU_Tainan/js/bootstrap_min_js?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>
 
     <script src="https://2018.igem.org/Template:NCKU_Tainan/js/bootstrap_min_js?action=raw&amp;ctype=text/javascript"></script>

Revision as of 06:28, 6 October 2018

Hardware

Follow us

Contact us

igem.ncku.tainan@gmail.com
No.1, Daxue Rd., East Dist., Tainan City 701, Taiwan (R.O.C.)