Difference between revisions of "Team:XMU-China/Notebook"

Line 33: Line 33:
 
     <!-- windows phone 点击无高光 -->
 
     <!-- windows phone 点击无高光 -->
 
     <title>Team:XMU-China/Notebook - 2018.igem.org</title>
 
     <title>Team:XMU-China/Notebook - 2018.igem.org</title>
−
     <link rel="stylesheet" href="css/cover.css">
+
     <link rel="stylesheet" href="css/notebook.css">
−
     <link rel="stylesheet" href="css/nav.css">
+
     <link rel="stylesheet" href="css/font.css">
−
     <link rel="stylesheet" href="css/footer.css">
+
     <link href="http://cdn.bootcss.com/font-awesome/4.7.0/css/font-awesome.min.css" rel="stylesheet">
−
    <link rel="stylesheet" href="css/nav_mobile.css">
+
     <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Team:XMU-China/css/font?action=raw&ctype=text/css"> -->
−
     <link rel="stylesheet" href="css/time.css">
+
     <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Team:XMU-China/css/cover?action=raw&ctype=text/css">
−
    <link href="http://cdn.bootcss.com/font-awesome/4.7.0/css/font-awesome.min.css" rel="stylesheet">     
+
−
  <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Team:XMU-China/css/cover?action=raw&ctype=text/css">
+
 
     <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Team:XMU-China/css/footer?action=raw&ctype=text/css">
 
     <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Team:XMU-China/css/footer?action=raw&ctype=text/css">
 
     <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Team:XMU-China/css/nav?action=raw&ctype=text/css">
 
     <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Team:XMU-China/css/nav?action=raw&ctype=text/css">
 
     <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Team:XMU-China/css/nav_mobile?action=raw&ctype=text/css">  
 
     <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Team:XMU-China/css/nav_mobile?action=raw&ctype=text/css">  
−
     <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Team:XMU-China/css/time_line?action=raw&ctype=text/css">
+
     <link rel="stylesheet" href="https://2018.igem.org/Team:XMU-China/css/engineering?action=raw&ctype=text/css">
 
     <script src="js/jquery-1.11.0.min.js" type="text/javascript"></script>
 
     <script src="js/jquery-1.11.0.min.js" type="text/javascript"></script>
 
     <script type="text/javascript" src="js/jquery.SuperSlide2.1.2.js"></script>
 
     <script type="text/javascript" src="js/jquery.SuperSlide2.1.2.js"></script>
−
     <script src="https://2018.igem.org/Team:XMU-China/js/time_line?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
     <script src="https://2018.igem.org/Team:XMU-China/js/time_line?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
</head>
  
 
<body>
 
<body>
Line 84: Line 83:
 
                         </li>
 
                         </li>
 
                         <li class="Human_Practice">
 
                         <li class="Human_Practice">
−
                        <a href="#">Human Practice</a>
+
                            <a href="#">Human Practice</a>
 
                             <ul>
 
                             <ul>
 
                                 <li><a href="https://2018.igem.org/Te
 
                                 <li><a href="https://2018.igem.org/Te
Line 96: Line 95:
 
                         </li>
 
                         </li>
 
                         <li class="Other_Works">
 
                         <li class="Other_Works">
−
                        <a href="#">Other Works</a>
+
                            <a href="#">Other Works</a>
 
                             <ul>
 
                             <ul>
 
                                 <li><a href="https://2018.igem.org/Team:XMU-China/InterLab">InterLab</a></li>
 
                                 <li><a href="https://2018.igem.org/Team:XMU-China/InterLab">InterLab</a></li>
Line 211: Line 210:
 
         </div>
 
         </div>
 
         <div class="main">
 
         <div class="main">
−
 
 
             <div class="event_box">
 
             <div class="event_box">
 
                 <div class="space_div">
 
                 <div class="space_div">
Line 217: Line 215:
 
                     <p class="right_space"></p>
 
                     <p class="right_space"></p>
 
                 </div>
 
                 </div>
−
                 <div class="parHd clearfix">
+
                 <div class="parHd clearfix notebook" id="engineering">
 
                     <div class="limited_framework">
 
                     <div class="limited_framework">
 
                         <ul>
 
                         <ul>
−
                             <li class="act"><span></span>week0</li>
+
                             <li class="act"><span></span>Mar</li>
−
                             <li><span></span>week1</li>
+
                             <li><span></span>Apr</li>
−
                             <li><span></span>week2</li>
+
                             <li><span></span>May</li>
−
                             <li><span></span>week3</li>
+
                             <li><span></span>Jun Wk 1-3</li>
−
                             <li><span></span>week4</li>
+
                             <li><span></span>Jun Wk 4</li>
−
                             <li><span></span>week5</li>
+
                             <li><span></span>Jul Wk 3</li>
−
                             <li><span></span>week6</li>
+
                             <li><span></span>Jul Wk 4</li>
−
                             <li><span></span>week7</li>
+
                             <li><span></span>Aug Wk 1</li>
−
                             <li><span></span>week8</li>
+
                             <li><span></span>Aug Wk 2</li>
−
                             <li><span></span>week9</li>
+
                             <li><span></span>Aug Wk 3</li>
 +
                            <li><span></span>Aug Wk 4</li>
 +
                            <li><span></span>Sep Wk 1</li>
 +
                            <li><span></span>Sep Wk 2</li>
 +
                            <li><span></span>Sep Wk 3</li>
 +
                            <li><span></span>Sep Wk 4</li>
 +
                            <li><span></span>Oct Wk 1</li>
 +
                            <li><span></span>Oct Wk 2</li>
 
                         </ul>
 
                         </ul>
 
                         <a class="sPrev"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/5/59/T--XMU-China--timeline_left.png"></a>
 
                         <a class="sPrev"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/5/59/T--XMU-China--timeline_left.png"></a>
Line 235: Line 240:
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                 </div>
 
                 </div>
−
                 <div class="parBd clearfix">
+
                 <div class="parBd clearfix notebook">
 
                     <div class="slideBox">
 
                     <div class="slideBox">
−
                         <h4>week0</h4>
+
                         <h1>Mar</h1>
−
                         <p>Protein plays a significant role in performing physiological functions[1], however, in diseased cells, protein carrying out a certain function may indicate the proceedings of disease. Such protein could be sorted to biomarkers, which have been regarded as the targets of disease detection and treatment in recent years.</p>
+
                         <p>- Our team was formally founded. <br>
 +
                            - All student members learned the fundamental knowledge of molecular cloning and iGEM. <br>
 +
                            - All student members looked through the previous excellent projects and learned the basic notion of synthetic biology and iGEM. <br>
 +
                        </p>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
−
                         <h4>week1</h4>
+
                         <h1>Apr</h1>
−
                         <p>[2]~[4] Therefore, detecting those biomarkers of protein-type becomes more and more critical to biological and medical fields. There are two main detecting approaches to detect a particular protein in a complex sample. One is direct determination of the content after purification, another is binding assays which include a target recognition probe and a signal transducer.[6]~[9] They are commonly selected from random sequence libraries, using the systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX) techniques.[10] Advantages of aptamers over antibodies include longer shelf life, improved thermal stability and ease of modification and conjugation.[11] An interesting binding assay is to use aptamers as the target recognition probes and CRISPR-Cas12a(Cpf1) as the signal amplifier, which is called Aptamer Based Cell-free Detection system(ABCD system, Figure 1). We developed this system to detect those biomarkers of protein-type for the purpose of disease detection or staging.</p>
+
                         <p>- We were divided into four groups and started to brainstorm separately (and we reported each’s progress every weekend). <br>
 +
                            - Our team was formally accepted by iGEM.
 +
                        </p>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="slideBox" style="display: none;">
 +
                        <h1>May</h1>
 +
                        <p>- Our formal project was confirmed. <br>
 +
                            - The pre-experiment plan was confirmed. <br>
 +
                            - The division of labor was confirmed.
 +
                        </p>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="slideBox" style="display: none;">
 +
                        <h1>Jun Wk1-3</h1>
 +
                        <p> -All student members learned laboratory fundamental qualities and received molecular cloning operation training.
 +
                        </p>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="slideBox" style="display: none;">
 +
                        <h1>Jun Wk 4</h1>
 +
                        <p>- 2018 DNA Distribution Kit Plates were received.<br>
 +
                            - We transformed the biobricks which we needed.<br>
 +
                            - <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_J04450">BBa_J04450</a> constructed to get the backbone.
 +
                        </p>
 +
                        <p class="F3">
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/e/e8/T--XMU-China--BBa_J04450.jpeg">
 +
                        </p>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="slideBox" style="display: none;">
 +
                        <h1>Jul Wk 3</h1>
 +
                        <p>– The genetic circuit of the TDP began to be built.</p>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="slideBox" style="display: none;">
 +
                        <h1>Jul Wk 4</h1>
 +
                        <p>– Interlab experiments.</p>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="slideBox" style="display: none;">
 +
                        <h1>Aug Wk 1</h1>
 +
                        <p>– The genetic circuit of the Kai began to be built.</p>
 +
                    </div>
 +
                    <div class="slideBox " style="display: none;">
 +
                        <h1>Aug Wk 2</h1>
 +
                        <p class="left_align">– <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623015">BBa_K2623015</a>constructed.</p>
 +
                        <p class="dipic_3">
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/7/72/T--XMU-China--BBa_K2623015.png">
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/a/a9/T--XMU-China--BBa_K2623015_1.jpeg">
 +
                        </p>
 +
                            <p class="left_align">
 +
                                - <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623009">BBa_K2623009</a>constructed.
 +
                            </p>
 +
                            <p class="F7">
 +
                                <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/1/17/T--XMU-China--BBa_K2623009.png">
 +
                        </p>
 +
                                <p class="left_align">– <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623016">BBa_K2623016</a>constructed.
 +
                                </p>
 +
                                <p class="dipic_4">
 +
                                    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/d/da/T--XMU-China--BBa_K2623016.png">
 +
                                    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/9/98/T--XMU-China--BBa_K2623016_1.jpeg">
 +
                        </p>
 +
                                    <p class="left_align">- The genetic circuit of SAHS was completed and protein validation began.
 +
                                    </p>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
−
                         <h4>week2</h4>
+
                         <h1>Aug Wk 3</h1>
−
                         <p> The former approach includes gel filtration chromatography, ion exchange chromatography and nickel column and more, but these methods have high costs, strict equipment requirements and other issues, which are not suitable for promotion and application. The enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) is a typical representative of the latter approach, nevertheless, such assays using antibodies as affinity ligands have cross-reactivity of antibodies compromising the specificity to the target of interest.</p>
+
                         <p class="left_align">- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623001">BBa_K2623001</a> constructed.</p>
 +
                        <p class="F8">
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/8/8a/T--XMU-China--BBa_K2623001.png">
 +
                        </p>
 +
                            <p class="left_align">- <a href="ttp://parts.igem.org/Part:BBa_K2623022">BBa_K2623022</a> and <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623024">BBa_K2623024</a> constructed.
 +
                            </p>
 +
                            <p class="F25">
 +
                                <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/c/c7/T--XMU-China--BBa_K2623022_4.jpeg">
 +
                        </p>
 +
                                <p class="left_align">- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_I13401">BBa_I13401</a> constructed to get the GFP reporter.
 +
                                </p>
 +
                                <p class="F25">
 +
                                    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/a/a7/T--XMU-China--BBa_I13401.jpeg">
 +
                        </p>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
−
                         <h4>week3</h4>
+
                         <h1>Aug Wk 4</h1>
−
                         <p>[5] What’s worse, the premise of using ELISA is the need to find the corresponding antibodies, but the fact is that not all proteins can find their specific antibody protein, so the use of ELISA is also limited. Binding assays using aptamers as affinity ligands to recognize specific proteins are better than those using antibodies. Aptamers are short, synthetic single stranded oligonucleotides (DNA or RNA) that can bind to target molecules with high affinity and specificity.</p>
+
                         <p class="left_align">- <a href="ttp://parts.igem.org/Part:BBa_K2623021">BBa_K2623021</a> and <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623023">BBa_K2623023</a> constructed.</p>
 +
                        <p class="F25">
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/9/9a/T--XMU-China--BBa_K2623021_3.jpeg">
 +
                        </p>
 +
                            <p class="left_align">- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623026">BBa_K2623026</a> constructed.</p>
 +
                            <p class="F25">
 +
                                <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/7/7c/T--XMU-China--BBa_K2623026.jpeg">
 +
                        </p>
 +
                                - Aptamer and ssDNA successfully combined.
 +
                                <p class="F25">
 +
                                    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/9/93/T--XMU-China--ssDNA-Aptamer.jpeg">
 +
                        </p>
 +
                                    <p class="left_align">- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623002">BBa_K2623002</a> constructed.</p>
 +
                                    <p class="F8">
 +
                                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/d/d7/T--XMU-China--BBa_K2623002.png">
 +
                        </p>
 +
                                        <p class="left_align">- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623003">BBa_K2623003</a> constructed.</p>
 +
                                        <p class="F8">
 +
                                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/1/16/T--XMU-China--BBa_K2623003.png">
 +
                        </p>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
−
                         <h4>week4</h4>
+
                         <h1>Sep Wk 1</h1>
−
                         <p>详细信息</p>
+
                         <p>- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623014">BBa_K2623014</a> constructed.</p>
 +
                        <p class="F25">
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/9/93/T--XMU-China--BBa_K2623014.png">
 +
                        </p>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
−
                         <h4>week5</h4>
+
                         <h1>Sep Wk 2</h1>
−
                         <p>详细信息</p>
+
                         <p class="left_align">- GFP on <a href="ttp://parts.igem.org/Part:BBa_K2623021">BBa_K2623021</a> and <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623023">BBa_K2623023</a> successfully expressed.</p>
 +
                        <p class="dipic_4">
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/e/e0/T--XMU-China--BBa_K2623021.jpeg">
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/f/f6/T--XMU-China--BBa_K2623023.jpeg">
 +
                        </p>
 +
                            <p class="left_align">- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623004">BBa_K2623004</a> constructed.</p>
 +
                            <p class="F25">
 +
                                <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/c/cd/T--XMU-China--BBa_K2623004.png">
 +
                        </p>
 +
                                <p class="left_align">- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623005">BBa_K2623005</a> constructed.</p>
 +
                                <p class="F25">
 +
                                    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/d/dd/T--XMU-China--BBa_K2623005.png">
 +
                        </p>
 +
                                    <p class="left_align">- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623006">BBa_K2623006</a> constructed.</p>
 +
                                    <p class="F25">
 +
                                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/e/ef/T--XMU-China--BBa_K2623006.png">
 +
                        </p>
 +
                                        <p class="left_align">- First time successful purification of high-purity SAHS protein.</p>
 +
                                        <p class="F25">
 +
                                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/f/f0/T--XMU-China--SAHS_protein.png">
 +
                        </p>
 +
                                            <p class="left_align">- Coating experiment on microfluidic chips succeeded. <br>
 +
                                                - Started bacterial freeze-drying experiment.
 +
                                            </p>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
−
                         <h4>week6</h4>
+
                         <h1>Sep Wk 3</h1>
−
                         <p>详细信息</p>
+
                         <p class="left_align">- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_E1010"> BBa_E1010</a> constructed to get the mRFP reporter.</p>
 +
                        <p class="F25">
 +
                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/f/fb/T--XMU-China--BBa_E1010.jpeg">
 +
                        </p>
 +
                            <p class="left_align">- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623011"> BBa_K2623011</a> constructed.
 +
                                <p class="F25">
 +
                                    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/8/8b/T--XMU-China--BBa_K2623011.png">
 +
                        </p>
 +
                                    <p class="left_align">- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623007"> BBa_K2623007</a> constructed.
 +
                                        <p class="F25">
 +
                                            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/9/92/T--XMU-China--BBa_K2623007.png">
 +
                        </p>
 +
                                            <p class="left_align">- Competition experiment succeeded.<br>
 +
                                                - Started protein freeze-drying experiment.
 +
                                            </p>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
−
                         <h4>week7</h4>
+
                         <h1>Sep Wk 4</h1>
−
                         <p>详细信息</p>
+
                         <p class="left_align">- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623025"> BBa_K2623025</a> constructed.
 +
                            <p class="F25">
 +
                                <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/7/77/T--XMU-China--BBa_K2623025.jpeg">
 +
                        </p>
 +
                                <p class="left_align">- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623008"> BBa_K2623008</a> constructed.
 +
                                    <p class="F25">
 +
                                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/6/60/T--XMU-China--BBa_K2623008.png">
 +
                        </p>
 +
                                        <P class="left_align">- Started try genetic recombination experiment. </P>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
−
                         <h4>week8</h4>
+
                         <h1>Oct Wk 1</h1>
−
                         <p>详细信息</p>
+
                         <p class="left_align">- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623027"> BBa_K2623027</a> constructed.
 +
                            <p class="F25">
 +
                                <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/4/48/T--XMU-China--BBa_K2623027.jpeg">
 +
                        </p>
 +
                                <p class="left_align">- <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K2623013"> BBa_K2623013</a> constructed.
 +
                                    <p class="F25">
 +
                                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/c/cb/T--XMU-China--BBa_K2623013.png">
 +
                        </p>
 +
                                        <p class="left_align">- NG2+5, NG2+6, NG4+5, NG4+6 constructed.
 +
                                        </p>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
 
                     <div class="slideBox" style="display: none;">
−
                         <h4>week9</h4>
+
                         <h1>Oct Wk 2</h1>
 
                         <p>详细信息</p>
 
                         <p>详细信息</p>
 
                     </div>
 
                     </div>

Revision as of 15:31, 10 October 2018

Team:XMU-China/Notebook - 2018.igem.org -->

Model
Notebook

  • Mar
  • Apr
  • May
  • Jun Wk 1-3
  • Jun Wk 4
  • Jul Wk 3
  • Jul Wk 4
  • Aug Wk 1
  • Aug Wk 2
  • Aug Wk 3
  • Aug Wk 4
  • Sep Wk 1
  • Sep Wk 2
  • Sep Wk 3
  • Sep Wk 4
  • Oct Wk 1
  • Oct Wk 2

Mar

- Our team was formally founded.
- All student members learned the fundamental knowledge of molecular cloning and iGEM.
- All student members looked through the previous excellent projects and learned the basic notion of synthetic biology and iGEM.

  • Home
  • Basic Part
  • About us
  • Composite Part
  • Attribution
  • Design
  • Modeling
  • Engagemen
  • Biosafety
  • Contribution
  • Collaboration
  • Protocols
  • Notebook
  • Description
  • Experiment